More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1718 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  100 
 
 		 247 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  74.26 
 
 		 241 aa  355  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  46.89 
 
 		 263 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  39.53 
 
 		 276 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  39.92 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.17 
 
 		 733 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.04 
 
 		 727 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  35.69 
 
 		 728 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.69 
 
 		 728 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  35.69 
 
 		 751 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  37.45 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  36.22 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  37.32 
 
 		 728 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.43 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  36.62 
 
 		 728 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.83 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  38.06 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  39.18 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  36.88 
 
 		 753 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.36 
 
 		 728 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.06 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  37.25 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  38.4 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.99 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.99 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  36.99 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  32.16 
 
 		 760 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  37.25 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.99 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.99 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  33.66 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.29 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  37.5 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.18 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  36.59 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.3 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.18 
 
 		 306 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.6 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.3 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  38.02 
 
 		 323 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  36 
 
 		 320 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.88 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.43 
 
 		 720 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  36 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36 
 
 		 333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  36.18 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.18 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.59 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.15 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.48 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  36.59 
 
 		 349 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.88 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  33.88 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.18 
 
 		 474 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.88 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.88 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.47 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  35.97 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.47 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.88 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  35.83 
 
 		 346 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.48 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  35.83 
 
 		 346 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.8 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  35.66 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  36.33 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  42.68 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  38.1 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  35.42 
 
 		 790 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  35.92 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  35.82 
 
 		 798 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  37.07 
 
 		 358 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.82 
 
 		 796 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  43.48 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  32.98 
 
 		 740 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  36.13 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.6 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.38 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  35.39 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  35.25 
 
 		 803 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  35.25 
 
 		 803 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  32.75 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  35.25 
 
 		 803 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  34.51 
 
 		 777 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  35 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  38.38 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.47 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  31.21 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  35 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  34.51 
 
 		 750 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  36.67 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  34.98 
 
 		 852 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  36.65 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  36.78 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.53 
 
 		 735 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  34.32 
 
 		 813 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  35.25 
 
 		 767 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30.28 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  43.98 
 
 		 317 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>