More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1656 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  74.26 
 
 		 247 aa  355  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  47.26 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  42.63 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  40.17 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  36.29 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  35.02 
 
 		 330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  37.05 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36.65 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.8 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  32.25 
 
 		 760 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  36.55 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  36.65 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.86 
 
 		 346 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.35 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  34.6 
 
 		 348 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.95 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.76 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.99 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.36 
 
 		 728 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.19 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.19 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.56 
 
 		 727 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  33.58 
 
 		 796 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.77 
 
 		 263 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.77 
 
 		 263 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.77 
 
 		 263 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.77 
 
 		 263 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.35 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  33.58 
 
 		 798 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.93 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  33.05 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  36.21 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.21 
 
 		 852 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.36 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.21 
 
 		 728 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.21 
 
 		 728 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  32.48 
 
 		 728 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  36.67 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  30.28 
 
 		 733 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.33 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.85 
 
 		 751 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  33.46 
 
 		 813 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.95 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  31.23 
 
 		 352 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  34.75 
 
 		 346 aa  121  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  34.75 
 
 		 346 aa  121  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  32.84 
 
 		 714 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.75 
 
 		 728 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.76 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  34.41 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.79 
 
 		 323 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  32.47 
 
 		 945 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  32.47 
 
 		 933 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  32.47 
 
 		 920 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  32.47 
 
 		 930 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  34.06 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.84 
 
 		 803 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.75 
 
 		 320 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  33.33 
 
 		 804 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  32.47 
 
 		 728 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.84 
 
 		 803 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  32.73 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  31.23 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.84 
 
 		 803 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  35.25 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.64 
 
 		 302 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  44.1 
 
 		 317 aa  118  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  32.7 
 
 		 320 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  30.6 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  32.56 
 
 		 314 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  30.72 
 
 		 354 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  32.99 
 
 		 330 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  32.7 
 
 		 320 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.22 
 
 		 323 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  34.29 
 
 		 790 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  34.68 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  28.07 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  30.27 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  34.84 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  30.32 
 
 		 720 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  31.27 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  31.93 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  34.84 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  34.84 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  28.07 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  30.8 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30.74 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  30.69 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.71 
 
 		 753 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  34.27 
 
 		 358 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>