More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0408 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0408  Patatin  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  42.62 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  40.08 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  36.86 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  34.82 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  38.02 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  31.17 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  43.48 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.2 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  31.02 
 
 		 360 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  38.96 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.81 
 
 		 324 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  36.21 
 
 		 347 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.8 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.88 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  38.33 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.2 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.08 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  40.62 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.63 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.08 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.08 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  30.47 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.63 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.08 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  30 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.69 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.2 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.02 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.24 
 
 		 760 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  34.25 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  27.64 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  29.55 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  29.39 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  39.35 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  36.81 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.56 
 
 		 740 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  29.1 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4392  patatin  34.29 
 
 		 344 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  34.29 
 
 		 344 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  34.29 
 
 		 344 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  28.29 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.74 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  38.75 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.19 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.81 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.2 
 
 		 311 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.72 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.53 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.54 
 
 		 728 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  37.65 
 
 		 318 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.07 
 
 		 767 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  37.65 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  34.97 
 
 		 346 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  40.13 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  28.69 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27 
 
 		 727 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  28.57 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.54 
 
 		 728 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.57 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  35.52 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  33.66 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.13 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  26.34 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  28.62 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.2 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.61 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  33.89 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  33.73 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  32.12 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  37.29 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  33.33 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  35.8 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.49 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  31.49 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.51 
 
 		 751 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  31.27 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.51 
 
 		 728 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.51 
 
 		 728 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 583 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  32.35 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  36.2 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  33.88 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  34.97 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  32.14 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  31.46 
 
 		 740 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  33.54 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.72 
 
 		 751 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.54 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.58 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.58 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  31.08 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.58 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.42 
 
 		 335 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.78 
 
 		 322 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  28.63 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.59 
 
 		 323 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  35.22 
 
 		 327 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>