More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4239 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4239  Patatin  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  49.79 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  42.62 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  38.46 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  35.77 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  34.64 
 
 		 727 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  32.64 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  33.73 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.22 
 
 		 728 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.93 
 
 		 728 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.93 
 
 		 751 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.79 
 
 		 728 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.57 
 
 		 728 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.99 
 
 		 733 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.8 
 
 		 311 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.94 
 
 		 728 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.59 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.84 
 
 		 315 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.83 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  29.54 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  47.13 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.77 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.77 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  32.73 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  31.84 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  32.79 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.77 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.73 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.08 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.5 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  29.02 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  30.31 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.51 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.05 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.65 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.02 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.35 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  39.58 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.65 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.65 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.65 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.65 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.65 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.28 
 
 		 741 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.74 
 
 		 330 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.44 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  30 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  38.1 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  30.49 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  29.74 
 
 		 323 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  29.04 
 
 		 740 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  39.33 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  38.07 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  29.51 
 
 		 923 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.33 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.05 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  31.03 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  31.34 
 
 		 707 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  32.16 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  28.77 
 
 		 894 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.8 
 
 		 740 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  31.52 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.01 
 
 		 767 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  38.85 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.27 
 
 		 760 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.96 
 
 		 346 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.96 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  29.21 
 
 		 327 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  38.75 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  29.86 
 
 		 734 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  35.86 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  36.59 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.41 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  28.85 
 
 		 358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  32.84 
 
 		 738 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  37.42 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  28.08 
 
 		 775 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.34 
 
 		 754 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  33.66 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.58 
 
 		 753 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.34 
 
 		 347 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  30.53 
 
 		 750 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.34 
 
 		 347 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.81 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.06 
 
 		 474 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.81 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.81 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  36.81 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  31.41 
 
 		 737 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  28 
 
 		 981 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.02 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.14 
 
 		 777 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.81 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  33.46 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  37.42 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  27.03 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  36.16 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>