More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1081 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1081  patatin  100 
 
 		 322 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  53.72 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  51.64 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  39.92 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  39.16 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  40.36 
 
 		 295 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  38.41 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  35.74 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  33.93 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  34.91 
 
 		 267 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  36.1 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  33.44 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  35.31 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.13 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.65 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.93 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.63 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.65 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.26 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.79 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  33.1 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.58 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.93 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.54 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  29.33 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  32.47 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  30.57 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.93 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.93 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.93 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.98 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.58 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.18 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.21 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.18 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  33.23 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  36.69 
 
 		 253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  28.34 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  31.67 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  30.16 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.67 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  36.87 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  29.35 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  30.67 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  29.69 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.9 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  29.58 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.88 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  40.1 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30.63 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.01 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  36.36 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  35.86 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.89 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.17 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  28.57 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.45 
 
 		 767 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  29.55 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  35.86 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  31.13 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.14 
 
 		 760 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  36.55 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.56 
 
 		 740 aa  119  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.54 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.54 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.36 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  29.74 
 
 		 741 aa  119  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  32.38 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  34.38 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.47 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  36.98 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  31.64 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.49 
 
 		 740 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.64 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  29.18 
 
 		 667 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.35 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  34.14 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  29.69 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  29.5 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  40.93 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  31.27 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.35 
 
 		 777 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  28.85 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.42 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.27 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  40.72 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.27 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  31.65 
 
 		 735 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.27 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  31.12 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.27 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  31 
 
 		 751 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  28.31 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>