More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3040 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3040  patatin  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  82.11 
 
 
293 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  81.75 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  50.18 
 
 
293 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  51.3 
 
 
295 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  48.39 
 
 
293 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  45.91 
 
 
294 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  34.88 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  37.59 
 
 
320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  34.83 
 
 
267 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  33.93 
 
 
322 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  32.55 
 
 
264 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  32.25 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  31.49 
 
 
276 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  36.73 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  27.3 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  33.2 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  27.88 
 
 
305 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.43 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  31.2 
 
 
241 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  37.13 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  31.3 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.46 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.02 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.95 
 
 
306 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.08 
 
 
263 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.68 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.95 
 
 
347 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  33.98 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.95 
 
 
347 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
753 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.66 
 
 
308 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 
474 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  33.2 
 
 
358 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.65 
 
 
327 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32.95 
 
 
347 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  33.68 
 
 
250 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.46 
 
 
273 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  38.22 
 
 
327 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  35.26 
 
 
341 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  29.64 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.86 
 
 
253 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.52 
 
 
760 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  36.65 
 
 
292 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.52 
 
 
310 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  28.62 
 
 
335 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.68 
 
 
320 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  29.18 
 
 
263 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  30.58 
 
 
750 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  36.45 
 
 
318 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  36.13 
 
 
292 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  33.67 
 
 
345 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.51 
 
 
324 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  32.32 
 
 
348 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.41 
 
 
311 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  26.84 
 
 
300 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  33.07 
 
 
302 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  36.41 
 
 
318 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  34.34 
 
 
336 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.25 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  32.32 
 
 
346 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  32.83 
 
 
346 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.04 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.64 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.92 
 
 
293 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  31.49 
 
 
316 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.85 
 
 
263 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.85 
 
 
263 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  36.19 
 
 
315 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.64 
 
 
263 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.64 
 
 
263 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.64 
 
 
263 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.87 
 
 
349 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.41 
 
 
319 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.52 
 
 
330 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.67 
 
 
302 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  35.03 
 
 
310 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  27.71 
 
 
323 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.87 
 
 
308 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  28.67 
 
 
316 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  28.62 
 
 
852 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.41 
 
 
333 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  29.07 
 
 
320 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  34.76 
 
 
315 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  34.76 
 
 
315 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  35.96 
 
 
293 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  37.89 
 
 
343 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  26.99 
 
 
300 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  32.14 
 
 
256 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  29.07 
 
 
320 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  35.1 
 
 
315 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  25.86 
 
 
312 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.64 
 
 
728 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.99 
 
 
728 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.9 
 
 
315 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.6 
 
 
301 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>