More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2204 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  634    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  72.87 
 
 		 320 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  73.27 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  71.47 
 
 		 321 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  63.38 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  65.22 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  65.55 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  61.78 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  49.83 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  47.37 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  48.84 
 
 		 347 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  48.61 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  47.39 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  47.18 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  47.52 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  46.41 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  47.44 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  48.16 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  45.35 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  46.44 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  44.64 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  49.29 
 
 		 373 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  44.35 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  46.73 
 
 		 344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  47.75 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  42.56 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  43 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  42.48 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  43.54 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  42.81 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  57.75 
 
 		 368 aa  218  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  43.1 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  42.75 
 
 		 292 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  42.03 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  40.34 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  40.34 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  40.13 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  42.19 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  37.86 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  37.42 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.73 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  43.3 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  39.33 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  38.51 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  38.51 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  38.51 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  38.51 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  38.51 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  39.29 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  39.29 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  41.72 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  38.59 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  38.26 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  41.61 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  38.26 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  38.26 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  41.23 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  38.26 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  38.18 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  38.19 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  39.64 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  38.36 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  37.89 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  40.07 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  40.07 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  40.07 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  39.79 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  40.07 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  42.11 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  41.1 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  42.11 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  42.25 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  36.08 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  40.13 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  41.44 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  41.4 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  36.6 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  36.49 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1538  patatin  41.4 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.546797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  37.81 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  35.94 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  34.83 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  49.44 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  40.43 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2126  patatin  35.4 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  hitchhiker  0.00774444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  36.33 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  34.12 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1920  patatin  40.51 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  34.75 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  43.33 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.09 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  35.14 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  34.36 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  33.74 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  33.44 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  35.83 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  33.13 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  35.23 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  35.36 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.82 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>