More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11081 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  65.78 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  65.78 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4392  patatin  65.78 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  65.61 
 
 
333 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2030  patatin  65.87 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1481  Patatin  50 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  44.51 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  42.29 
 
 
345 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  42.37 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  39.88 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  39.88 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  42.09 
 
 
348 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  40.68 
 
 
346 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  45.97 
 
 
293 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  42.09 
 
 
346 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  38.89 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  42.86 
 
 
329 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  41.18 
 
 
336 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  37.17 
 
 
295 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2126  patatin  38.02 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  hitchhiker  0.00774444 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  35.98 
 
 
293 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  37.72 
 
 
313 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  38.6 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  38.97 
 
 
325 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  54.24 
 
 
326 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  35.98 
 
 
291 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  35.57 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.23 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.61 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.63 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  36.64 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  35.52 
 
 
335 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  33.54 
 
 
304 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  35.74 
 
 
316 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  32.31 
 
 
311 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  33.72 
 
 
354 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  31.79 
 
 
292 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  35.44 
 
 
316 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32.1 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  32.71 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  32.71 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  36.44 
 
 
351 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  33.82 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  32.71 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  33.02 
 
 
301 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.94 
 
 
300 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  31.78 
 
 
305 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  31.45 
 
 
333 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  36.06 
 
 
352 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.2 
 
 
335 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  44.97 
 
 
373 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  31.74 
 
 
348 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  30.99 
 
 
300 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.16 
 
 
327 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  30.82 
 
 
301 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  32.4 
 
 
300 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  32.44 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  32.82 
 
 
352 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  32.63 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  31.02 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  33.15 
 
 
326 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.46 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  30.59 
 
 
311 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.93 
 
 
321 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  31.35 
 
 
312 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.05 
 
 
323 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  37.17 
 
 
343 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  31.67 
 
 
328 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  42.39 
 
 
314 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  41.85 
 
 
315 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  41.85 
 
 
315 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  42.78 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  42.22 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  32.93 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  42.22 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.53 
 
 
263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  42.22 
 
 
263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  31.62 
 
 
368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  42.22 
 
 
263 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  31.75 
 
 
320 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  42.22 
 
 
263 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  42.22 
 
 
263 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  41.67 
 
 
263 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  42.22 
 
 
263 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  32.3 
 
 
320 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  36.52 
 
 
263 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  43.39 
 
 
327 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  30.79 
 
 
315 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  30.79 
 
 
315 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>