More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3310 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  34.83 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  37.96 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  34.77 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  37 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  38.46 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  41.95 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  33.09 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  33.09 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  35.56 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  37.96 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  34.91 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  35.32 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  33.85 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.17 
 
 		 728 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.22 
 
 		 728 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.69 
 
 		 728 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.22 
 
 		 751 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.22 
 
 		 727 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  35.66 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.59 
 
 		 728 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.52 
 
 		 728 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  28.8 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.4 
 
 		 733 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  33.46 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  28.52 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  28.93 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  35.18 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  35.32 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  31.5 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.26 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.88 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.35 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.59 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.99 
 
 		 760 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.44 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  31.27 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  26.78 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  28.29 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  29.34 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  36.49 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  26.98 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  26.87 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.31 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  33.07 
 
 		 804 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.65 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  26.87 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.24 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  28.77 
 
 		 326 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  28.2 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 		 852 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  27.97 
 
 		 354 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  29.9 
 
 		 347 aa  99  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.62 
 
 		 753 aa  98.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.1 
 
 		 738 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  31.44 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  34.62 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.02 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.03 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.68 
 
 		 803 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 		 933 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.89 
 
 		 798 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  30.74 
 
 		 920 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 		 728 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.3 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.68 
 
 		 803 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 		 945 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  31.89 
 
 		 796 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.68 
 
 		 803 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.44 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  29.44 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.43 
 
 		 740 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  30.74 
 
 		 930 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  29.44 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  30.24 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  30.13 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  28.62 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  30.36 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  32.28 
 
 		 813 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  30 
 
 		 767 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.03 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.47 
 
 		 345 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  35.5 
 
 		 327 aa  95.9  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  32.6 
 
 		 327 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.03 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.03 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.03 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  27.44 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  39.41 
 
 		 360 aa  95.5  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.03 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.02 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  28.9 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  30.34 
 
 		 714 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  36.27 
 
 		 777 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  31.3 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  35.88 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  31.01 
 
 		 750 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.17 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  34.71 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  28.51 
 
 		 346 aa  92.8  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>