More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0418 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0418  patatin  100 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  58.22 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  58.1 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  57.89 
 
 		 295 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  57.99 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  47.6 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  45.49 
 
 		 293 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  46.38 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  38.41 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  37.02 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  36.19 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  36.99 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  33.58 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  38.71 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.33 
 
 		 767 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  30.53 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.85 
 
 		 263 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.69 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.21 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.09 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.57 
 
 		 753 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  29.91 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.46 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  32.14 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.62 
 
 		 728 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.05 
 
 		 263 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.05 
 
 		 263 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.45 
 
 		 316 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.62 
 
 		 751 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.49 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.73 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.93 
 
 		 727 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.2 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  32.47 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.7 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.85 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.63 
 
 		 728 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.98 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.33 
 
 		 760 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.01 
 
 		 728 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.47 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  33.33 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.19 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  36.51 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  31.37 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  28.52 
 
 		 335 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.13 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.88 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  30.42 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.56 
 
 		 728 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.85 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.85 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.85 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.46 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.46 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  29.62 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  32.88 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.27 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.06 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.06 
 
 		 474 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.85 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.63 
 
 		 728 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  29.89 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.06 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  29.89 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  29.26 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  31.86 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  31.86 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.5 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  31.11 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  31.47 
 
 		 790 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.29 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  30.18 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  31.35 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  34.29 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  32.96 
 
 		 933 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  32.96 
 
 		 945 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  32.96 
 
 		 728 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  32.96 
 
 		 920 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  31.35 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  30.83 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  32.96 
 
 		 930 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  32.08 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  29.47 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.93 
 
 		 733 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.09 
 
 		 852 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.67 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30.14 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.04 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.35 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  32.76 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  36.18 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  33.12 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.38 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  30.11 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>