More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0432 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0432  patatin  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  56.27 
 
 		 293 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  59.6 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  51.3 
 
 		 291 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  54.93 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  54.84 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  50.18 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  49.82 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  42.24 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  40.36 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  38.49 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  38.46 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  34.62 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  35.36 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30.28 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  31.85 
 
 		 276 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.46 
 
 		 751 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.46 
 
 		 728 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.6 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.6 
 
 		 727 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.62 
 
 		 734 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.74 
 
 		 728 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  33.33 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.13 
 
 		 733 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.47 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.43 
 
 		 728 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.18 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.98 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.53 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.3 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.25 
 
 		 728 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.37 
 
 		 736 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.92 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.37 
 
 		 739 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.14 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.23 
 
 		 735 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.63 
 
 		 738 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  29.07 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  31.2 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  31.56 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  30.69 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  34.02 
 
 		 263 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  31 
 
 		 738 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.06 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  31 
 
 		 738 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.5 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.95 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  30.77 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.05 
 
 		 738 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.05 
 
 		 737 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  32.31 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.05 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.05 
 
 		 738 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  34.15 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.16 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.89 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.03 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.48 
 
 		 737 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.17 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.03 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.2 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.5 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.33 
 
 		 738 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  30.69 
 
 		 738 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.53 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  30.71 
 
 		 327 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  32.71 
 
 		 358 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  29.66 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.13 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.83 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.64 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.22 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.83 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  28.85 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.82 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.83 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.13 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.83 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.33 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.71 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.1 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.31 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.31 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.31 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.31 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  30.51 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  26.65 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  29.8 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.71 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.47 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.92 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.21 
 
 		 760 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  28.15 
 
 		 750 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.74 
 
 		 754 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32.45 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  28.3 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  33.45 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.18 
 
 		 741 aa  102  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.95 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.95 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>