More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0209 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  98.98 
 
 
303 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  82.11 
 
 
291 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  49.1 
 
 
293 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  50.18 
 
 
295 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  48.39 
 
 
293 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  45.53 
 
 
294 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  49.81 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  33.09 
 
 
267 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  32.49 
 
 
312 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  33.1 
 
 
320 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  33.1 
 
 
322 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  30.89 
 
 
264 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  31.82 
 
 
330 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  29.76 
 
 
276 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  27.67 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35.9 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  31.03 
 
 
241 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.15 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  26.22 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.35 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.1 
 
 
298 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  29.5 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.2 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  38.31 
 
 
360 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  30.15 
 
 
252 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  29.8 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.67 
 
 
358 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.94 
 
 
251 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  27.61 
 
 
323 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.41 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  36.79 
 
 
327 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.31 
 
 
327 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.02 
 
 
302 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  35.47 
 
 
293 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  32.24 
 
 
321 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  25.57 
 
 
299 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  25.57 
 
 
299 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  27.36 
 
 
300 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.67 
 
 
349 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  28.79 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  28.79 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  28.79 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.82 
 
 
311 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  28.79 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  26.67 
 
 
300 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.52 
 
 
333 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.42 
 
 
318 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30 
 
 
306 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30 
 
 
347 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30 
 
 
347 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.42 
 
 
318 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  28.4 
 
 
263 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.3 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.79 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.79 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  26.6 
 
 
323 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  33.68 
 
 
250 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.54 
 
 
753 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  26.59 
 
 
335 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  33 
 
 
335 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  29.07 
 
 
301 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30.61 
 
 
302 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.2 
 
 
306 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  36.32 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.16 
 
 
301 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.67 
 
 
317 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  28.57 
 
 
263 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.2 
 
 
305 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  28.39 
 
 
303 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.2 
 
 
305 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.63 
 
 
347 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  28.13 
 
 
315 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  28.13 
 
 
315 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  28.13 
 
 
315 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.89 
 
 
308 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.21 
 
 
315 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  28.13 
 
 
315 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  30.74 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  34.09 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.75 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.07 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  33.85 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  38.15 
 
 
340 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  30.74 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  32.11 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  26.11 
 
 
304 aa  99.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  26.17 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  26.33 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  29.83 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.68 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  36.32 
 
 
360 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  31.12 
 
 
316 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.85 
 
 
319 aa  99  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  26.48 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.72 
 
 
760 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  33.85 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  33.85 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.37 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>