More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1839 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1839  patatin  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  40.73 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  40.58 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  40.58 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  39.84 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  36.03 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  33.58 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  35.07 
 
 		 293 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  37.17 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  33.84 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.9 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.06 
 
 		 302 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.1 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.63 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.86 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.73 
 
 		 318 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.73 
 
 		 318 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.08 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.44 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  29.7 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  32.72 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  30.29 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.08 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  32.35 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  35.38 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  33.71 
 
 		 292 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  31.92 
 
 		 316 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  33.47 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.33 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.52 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.72 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  34.01 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.45 
 
 		 346 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  33.06 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  29.86 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  31.98 
 
 		 345 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  33.06 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.65 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.73 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.65 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  34.01 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.54 
 
 		 348 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.65 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.18 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  30.83 
 
 		 346 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  30.83 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  28.43 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.65 
 
 		 302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.3 
 
 		 358 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  28.91 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  29.82 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.2 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  29.41 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  32.56 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  30.99 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  36.51 
 
 		 252 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  34.94 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.2 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  31.71 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  31.71 
 
 		 347 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  32.2 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  31.98 
 
 		 474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.98 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.69 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  28.37 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  31.98 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  34.63 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.8 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  33.74 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  27.7 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  26.86 
 
 		 314 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  31.91 
 
 		 340 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  28.98 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.29 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.46 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33.09 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  28.66 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.64 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  28 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.27 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.71 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.71 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.71 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.71 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  29.33 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.21 
 
 		 738 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  29.33 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.71 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  28 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  28 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.71 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.43 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  28 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  28 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>