More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0479 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  100 
 
 		 293 aa  583  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  94.2 
 
 		 293 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  58.22 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  63.41 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  56.27 
 
 		 295 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  50.18 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  49.1 
 
 		 293 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  49.1 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  35.33 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  35.74 
 
 		 322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  37.96 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  35.23 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  33.72 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  35.82 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.28 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  30.2 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.45 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.85 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.29 
 
 		 727 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.27 
 
 		 728 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.41 
 
 		 728 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.27 
 
 		 751 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  30.17 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  28.86 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.12 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30.91 
 
 		 728 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  29.55 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  30.34 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  37.76 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  30.58 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.12 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  30.68 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30 
 
 		 728 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.03 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.1 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.99 
 
 		 728 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.45 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.2 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  33.33 
 
 		 241 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.31 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.8 
 
 		 347 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.55 
 
 		 760 aa  99.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  28.52 
 
 		 741 aa  99.4  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  32.28 
 
 		 250 aa  99  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.84 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  32.51 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.8 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  28.21 
 
 		 733 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.39 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  32.51 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.87 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.8 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.8 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.39 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.18 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  27.95 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.61 
 
 		 474 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  29.55 
 
 		 346 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  35.61 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  34.03 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.98 
 
 		 349 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  29.78 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  34.36 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.06 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  27.9 
 
 		 751 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.16 
 
 		 324 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  37.95 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  35.23 
 
 		 360 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  33.33 
 
 		 336 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.98 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  31.56 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.7 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  26.33 
 
 		 738 aa  95.5  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  31.25 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  31.63 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.57 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  27.78 
 
 		 735 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.57 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  29.73 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.57 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  29.75 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  26.97 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.09 
 
 		 767 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  31.25 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  28.62 
 
 		 737 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.7 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.82 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.8 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  26.83 
 
 		 334 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  32.26 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  32.11 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  33.19 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.68 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  25.37 
 
 		 734 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.32 
 
 		 753 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.42 
 
 		 740 aa  92.8  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  36.5 
 
 		 360 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.3 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  32.79 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>