More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2802 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  36.59 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  36.51 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  38.02 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  36.1 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  36.03 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  32.8 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  37.09 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  29.82 
 
 		 727 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  33.2 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  38.46 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.37 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  30.92 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  31.92 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  37.91 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  33.06 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.92 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.47 
 
 		 728 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.47 
 
 		 751 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.37 
 
 		 316 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.47 
 
 		 728 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.17 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.17 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.36 
 
 		 728 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  29.89 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  38.04 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.75 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.75 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.75 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.75 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.52 
 
 		 760 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.75 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.79 
 
 		 728 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  25.1 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.99 
 
 		 728 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  30.58 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.57 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.94 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  31.05 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.23 
 
 		 733 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  36.2 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  31.45 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  27.38 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  36.2 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  29.34 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  31.2 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  31.97 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 740 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  31.85 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.17 
 
 		 734 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  28.1 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  29 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  27.45 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  29.8 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  30.45 
 
 		 767 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  28.51 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.15 
 
 		 298 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  27.8 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  27.8 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.45 
 
 		 301 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  32.34 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.91 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  26.75 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.42 
 
 		 358 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.44 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  35.54 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  28.63 
 
 		 346 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  28.63 
 
 		 346 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.53 
 
 		 327 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  34 
 
 		 751 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.03 
 
 		 320 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.98 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.03 
 
 		 320 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.59 
 
 		 738 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.04 
 
 		 798 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  35.54 
 
 		 358 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.04 
 
 		 796 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.52 
 
 		 275 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.17 
 
 		 738 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  27.66 
 
 		 894 aa  95.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.71 
 
 		 736 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.34 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.53 
 
 		 852 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.17 
 
 		 738 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  35.9 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  30.17 
 
 		 739 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.08 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  28.95 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  31.3 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  30.29 
 
 		 738 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  30.29 
 
 		 738 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.29 
 
 		 737 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  30.28 
 
 		 750 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  29.77 
 
 		 920 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  35.26 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  29.46 
 
 		 738 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  29.77 
 
 		 728 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>