More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0906 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  63.41 
 
 		 293 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  63.04 
 
 		 293 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  58.1 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  55.52 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  50 
 
 		 291 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  49.81 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  49.81 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  41.95 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  37.69 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  37.5 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  35.31 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  32.92 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  35.99 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  36.52 
 
 		 728 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  36.84 
 
 		 241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.82 
 
 		 728 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.1 
 
 		 760 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.97 
 
 		 728 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  34.63 
 
 		 753 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33 
 
 		 751 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33 
 
 		 728 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33 
 
 		 728 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  33.86 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.58 
 
 		 767 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  40.91 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.33 
 
 		 727 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  31.77 
 
 		 733 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  41.21 
 
 		 323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  39.29 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.16 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  33.73 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.71 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.73 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.8 
 
 		 748 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.16 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.12 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  29.97 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.42 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.57 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  31.44 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.37 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  29.47 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.62 
 
 		 741 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.37 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.37 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.37 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.76 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.37 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.37 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.98 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2126  patatin  31.01 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  hitchhiker  0.00774444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.78 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  35.6 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  35.6 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.88 
 
 		 740 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.26 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  30.94 
 
 		 751 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  34.04 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  36.98 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.62 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.85 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  35.71 
 
 		 336 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  33.19 
 
 		 360 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  35.11 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  38.34 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.29 
 
 		 738 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  28.8 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  28.8 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.64 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  37 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  32.02 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  34.9 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  29.7 
 
 		 754 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.36 
 
 		 790 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.16 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.4 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  26.9 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  34.57 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  34.57 
 
 		 346 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.26 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.97 
 
 		 346 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  33.51 
 
 		 346 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  26.13 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  28.9 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.26 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.57 
 
 		 736 aa  95.9  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.61 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.57 
 
 		 327 aa  95.5  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.1 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  33.51 
 
 		 348 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.07 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.98 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  26.16 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.25 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  25.88 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  29.81 
 
 		 737 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  28.95 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.25 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  32.07 
 
 		 776 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>