More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1022 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.8 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.11 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.35 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.35 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36.96 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.37 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  35.14 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.33 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  34.78 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  39.89 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  37.68 
 
 		 327 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  32.71 
 
 		 323 aa  128  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  36.16 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  36.4 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  34.41 
 
 		 314 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.13 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.47 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.54 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.02 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.02 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.02 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.02 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.54 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.02 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.02 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.62 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  31.89 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  34.41 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  32.96 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.41 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  28.78 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  43.33 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.41 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  34 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  43.33 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  31.29 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.8 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.35 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  28.06 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.53 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.39 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  32.38 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.95 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  39.9 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  41.05 
 
 		 323 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  33.92 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  33 
 
 		 390 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  34.24 
 
 		 347 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  28.52 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  39.78 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  33.79 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  31.54 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  32.62 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.6 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  32.81 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  32.16 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  30.25 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  36.87 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  43.89 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.56 
 
 		 741 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  32.08 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  37.97 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.87 
 
 		 753 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  30.53 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33.45 
 
 		 343 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  32.53 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.67 
 
 		 748 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  26.83 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  38.92 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  26.76 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  31.94 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  33.21 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  31.85 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  29.2 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  32.65 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  30.19 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.17 
 
 		 740 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  35.14 
 
 		 803 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  38.55 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.65 
 
 		 767 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  35.14 
 
 		 803 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  35.14 
 
 		 803 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.96 
 
 		 796 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.52 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30.53 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.4 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  31.85 
 
 		 343 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  35.75 
 
 		 930 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  35.75 
 
 		 920 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  36.49 
 
 		 813 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  35.08 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  35.14 
 
 		 804 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  38.89 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4392  patatin  38.89 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1920  patatin  34.65 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  38.89 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  35.75 
 
 		 933 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  34.55 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>