More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4236 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4392  patatin  100 
 
 
344 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  100 
 
 
344 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  100 
 
 
344 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  67.26 
 
 
333 aa  447  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  66.96 
 
 
360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2030  patatin  66.47 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  45.66 
 
 
360 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1481  Patatin  50.44 
 
 
339 aa  300  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  45.57 
 
 
293 aa  262  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  43.99 
 
 
347 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  39.6 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  39.6 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  43.11 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  39.27 
 
 
346 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  39.22 
 
 
345 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  39.89 
 
 
336 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  38.51 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  38.11 
 
 
346 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  38.22 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2126  patatin  37.13 
 
 
304 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  hitchhiker  0.00774444 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  39.1 
 
 
313 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  42.22 
 
 
340 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  37.54 
 
 
295 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  36.94 
 
 
293 aa  228  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  42.17 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  39.09 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  51.96 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.87 
 
 
300 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.45 
 
 
335 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  34.53 
 
 
316 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  34.23 
 
 
316 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.11 
 
 
322 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  33.15 
 
 
368 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  33.43 
 
 
335 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.64 
 
 
323 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  32.73 
 
 
301 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  32.02 
 
 
326 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  32.32 
 
 
315 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  31.94 
 
 
315 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.24 
 
 
315 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  32.11 
 
 
348 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  32.21 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.73 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  31.94 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33.13 
 
 
343 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  31.9 
 
 
314 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  31.9 
 
 
301 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  31.9 
 
 
301 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.63 
 
 
321 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  30.75 
 
 
327 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  32.34 
 
 
352 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  32.3 
 
 
347 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  36.25 
 
 
324 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  33.82 
 
 
352 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  30.63 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  36.94 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  33.23 
 
 
300 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  35.91 
 
 
373 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  32.04 
 
 
321 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  28.07 
 
 
303 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  29.22 
 
 
292 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  33.43 
 
 
310 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.64 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  38.64 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  30.18 
 
 
301 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  35.59 
 
 
317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  35.29 
 
 
317 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  32.1 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  29.82 
 
 
333 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  29.34 
 
 
305 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  29.91 
 
 
343 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  32.45 
 
 
351 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  30.55 
 
 
300 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  30.21 
 
 
345 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  30.75 
 
 
320 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  31.29 
 
 
312 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  31.56 
 
 
352 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  29.65 
 
 
341 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  40.44 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  30.82 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  32.63 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  31.52 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.94 
 
 
327 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  30.31 
 
 
343 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  31 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  31 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.6 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  31 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  31 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.61 
 
 
263 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>