More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1162 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  32.94 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  32.54 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  30.31 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  30.04 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  30.45 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  29.25 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  32.79 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.89 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  28.29 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  28.45 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  28.45 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.59 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  30.56 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  25.1 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  27.18 
 
 		 720 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  27.24 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  26.95 
 
 		 733 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  26.6 
 
 		 728 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.6 
 
 		 728 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  26.6 
 
 		 751 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.53 
 
 		 728 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  27.27 
 
 		 323 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.5 
 
 		 727 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  26.36 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  29.5 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  25.87 
 
 		 323 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  27.4 
 
 		 733 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  27.69 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  26.32 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  29.11 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  27.64 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.39 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  34.15 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  25.42 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  26.19 
 
 		 333 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  33.17 
 
 		 360 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.53 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  27.78 
 
 		 320 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  32.3 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  29.89 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  33.54 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  28.21 
 
 		 315 aa  91.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  26.81 
 
 		 746 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  25 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  25.79 
 
 		 320 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  26.69 
 
 		 728 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  25.79 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1920  patatin  29.39 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  30.51 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.3 
 
 		 740 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  32.02 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  27.46 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  25 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  25.99 
 
 		 728 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  35.48 
 
 		 315 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  25 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  35.48 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  25 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  34.84 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  25 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  33.74 
 
 		 345 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  25 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  25 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  35.48 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  25 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  34.09 
 
 		 333 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  35.48 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  35.48 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  34.84 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  34.84 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  33.54 
 
 		 304 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  29.25 
 
 		 301 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.1 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  27.05 
 
 		 735 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  24.58 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.77 
 
 		 741 aa  89.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  34.15 
 
 		 333 aa  89.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  32.93 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.54 
 
 		 293 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.18 
 
 		 760 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.75 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28.79 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  27.46 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  33.52 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  24.1 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4392  patatin  33.52 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  33.52 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  35.48 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.94 
 
 		 777 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  26.56 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  36.75 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.98 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  32.97 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.53 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  27.1 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  36.13 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>