More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1881 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  31.3 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  33.33 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  29.54 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  30.71 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.65 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.04 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  30.2 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  28.81 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  29.39 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  28.45 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  27.27 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  26.34 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  28.35 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  27.8 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  27.97 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  28.24 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.9 
 
 		 727 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.99 
 
 		 324 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  27.17 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.07 
 
 		 728 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.07 
 
 		 728 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.54 
 
 		 728 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.54 
 
 		 728 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  26.45 
 
 		 751 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  25.78 
 
 		 316 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  26.36 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  25.39 
 
 		 311 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  27 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  25.9 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  29.28 
 
 		 318 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.32 
 
 		 760 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  29.88 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  32.7 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.77 
 
 		 318 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  25.69 
 
 		 733 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.54 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  26.91 
 
 		 728 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  26.64 
 
 		 298 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  33.33 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  32.47 
 
 		 346 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  25.71 
 
 		 320 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  27.86 
 
 		 707 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  25.71 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  26.37 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.54 
 
 		 308 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1065 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  27.65 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  26.91 
 
 		 751 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  25.31 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  26.83 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  27.21 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.73 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  26.09 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  30 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  31.74 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.92 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  30.93 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  29.63 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.73 
 
 		 741 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.5 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  27.05 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  30.05 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  32.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  32.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.1 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  32.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  33.74 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.7 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  32.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  32.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  32.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  32.63 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.36 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  33.74 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  29.56 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  33.9 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  29.06 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  27.46 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.43 
 
 		 740 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.1 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  26.2 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  33.74 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  33.52 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  24.2 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  25.5 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  32.4 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.47 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  25.85 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  25.76 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  31.84 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  31.84 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.1 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  27.21 
 
 		 750 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  29.47 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  27.44 
 
 		 777 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25.19 
 
 		 740 aa  79.3  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.58 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.36 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.04 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>