More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0414 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  100 
 
 		 588 aa  1195    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  34.89 
 
 		 595 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  35.23 
 
 		 632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  33.81 
 
 		 593 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  33.15 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  33.97 
 
 		 615 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 702 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.11 
 
 		 789 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  32.38 
 
 		 776 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  28.5 
 
 		 647 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  28.52 
 
 		 665 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  29.15 
 
 		 663 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  29.71 
 
 		 595 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.14 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  28.84 
 
 		 653 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  26.89 
 
 		 653 aa  202  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  29.91 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  29.39 
 
 		 643 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.06 
 
 		 661 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  27.18 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  27.51 
 
 		 661 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  27.52 
 
 		 661 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  27.29 
 
 		 671 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  27.29 
 
 		 652 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  27.02 
 
 		 610 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  29.44 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  27.18 
 
 		 639 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  28.23 
 
 		 622 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.26 
 
 		 670 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  27.02 
 
 		 639 aa  179  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  29.26 
 
 		 607 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  28.01 
 
 		 622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  27.02 
 
 		 779 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  26.33 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  26.48 
 
 		 677 aa  170  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 633 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  29.34 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  28.35 
 
 		 620 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  26.05 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  25.39 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  25.54 
 
 		 610 aa  143  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  25.93 
 
 		 607 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.21 
 
 		 609 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.17 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  24.07 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 702 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.1 
 
 		 791 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 604 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 611 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  27.19 
 
 		 835 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  24.11 
 
 		 611 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 580 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 604 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  23.26 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  23.85 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  22.5 
 
 		 591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  22.96 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  23.9 
 
 		 573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  23.9 
 
 		 573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  23.9 
 
 		 573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23 
 
 		 583 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  23.9 
 
 		 605 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  23.71 
 
 		 605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  23.66 
 
 		 605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  22.33 
 
 		 583 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  23.52 
 
 		 682 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23 
 
 		 583 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  23.71 
 
 		 571 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  23.95 
 
 		 584 aa  113  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 597 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 790 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  24.3 
 
 		 601 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.08 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.13 
 
 		 784 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.78 
 
 		 749 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 582 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.1 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.23 
 
 		 576 aa  107  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.17 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.7 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.23 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.13 
 
 		 769 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  24.04 
 
 		 784 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  22.31 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  22.31 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  21.54 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.1 
 
 		 765 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.59 
 
 		 770 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  25.87 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  23.86 
 
 		 888 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  21.73 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>