More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3981 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  65.72 
 
 
629 aa  824    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  65.99 
 
 
612 aa  825    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  100 
 
 
598 aa  1232    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  73.46 
 
 
584 aa  902    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  33.15 
 
 
573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  31.27 
 
 
588 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  30.03 
 
 
578 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  31.41 
 
 
573 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  32.01 
 
 
596 aa  253  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  29.52 
 
 
558 aa  246  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  30.07 
 
 
555 aa  240  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  30.49 
 
 
578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  30.49 
 
 
578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  29.21 
 
 
591 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  30.49 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  29.83 
 
 
575 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  29.82 
 
 
583 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  30.83 
 
 
571 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  28.53 
 
 
611 aa  232  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  29.05 
 
 
574 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  30.11 
 
 
609 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  30.26 
 
 
571 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.57 
 
 
574 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  29.44 
 
 
577 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  29.44 
 
 
577 aa  226  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  29.44 
 
 
577 aa  226  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  29.44 
 
 
577 aa  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  29.44 
 
 
577 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  29.44 
 
 
577 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  29.9 
 
 
577 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  29.44 
 
 
577 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  29.44 
 
 
577 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  29.33 
 
 
580 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  27.68 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.94 
 
 
570 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  29.27 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  29.33 
 
 
583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  30.8 
 
 
577 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  30.8 
 
 
577 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  30.8 
 
 
577 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  29.37 
 
 
575 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  30.8 
 
 
577 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  30.8 
 
 
577 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  28.88 
 
 
608 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  26.63 
 
 
578 aa  220  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  29.09 
 
 
583 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  28.9 
 
 
579 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  26.46 
 
 
578 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  28.88 
 
 
607 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  28.48 
 
 
594 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  29.18 
 
 
636 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  28.35 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  26.97 
 
 
570 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  28.92 
 
 
579 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  28.52 
 
 
617 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  26.32 
 
 
617 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  27.66 
 
 
612 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  26.32 
 
 
617 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  26.16 
 
 
617 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  26.16 
 
 
617 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  27.9 
 
 
593 aa  208  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  26.76 
 
 
579 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  28.52 
 
 
612 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  27 
 
 
596 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  25.75 
 
 
582 aa  203  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  26.97 
 
 
618 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  26.72 
 
 
591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  27.06 
 
 
591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  26.72 
 
 
591 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  28.06 
 
 
603 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  27.6 
 
 
613 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  26.1 
 
 
621 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  25.4 
 
 
609 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.6 
 
 
601 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  27.22 
 
 
597 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  23.79 
 
 
591 aa  179  1e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  27.14 
 
 
573 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  27.14 
 
 
573 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  27.64 
 
 
612 aa  178  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  27.14 
 
 
573 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  27.17 
 
 
605 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  27.17 
 
 
605 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  26.96 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.96 
 
 
571 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  26.75 
 
 
604 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  26.62 
 
 
611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  26.52 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  27.62 
 
 
595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  27.39 
 
 
595 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  26.94 
 
 
604 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  26.94 
 
 
604 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  26.25 
 
 
611 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  26.75 
 
 
604 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  28.52 
 
 
589 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  26.06 
 
 
611 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  26.1 
 
 
611 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  25.83 
 
 
696 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  26.46 
 
 
682 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.96 
 
 
591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>