299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2126 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  66.37 
 
 		 570 aa  811    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  54.02 
 
 		 573 aa  654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  67.6 
 
 		 570 aa  826    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1189    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  42.18 
 
 		 571 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  42.14 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  40.83 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  41.14 
 
 		 591 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  41.36 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  41.67 
 
 		 594 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  39.55 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  39.55 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  39.55 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  40.32 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  40.14 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  40.32 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  40.32 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  40.32 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  40.14 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  40.31 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  40.31 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  40.14 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  40.31 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  37.75 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  40.31 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  40.14 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  39.97 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  39.97 
 
 		 577 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  35.24 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  37.43 
 
 		 558 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  35.71 
 
 		 573 aa  364  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  33.85 
 
 		 575 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  37.24 
 
 		 579 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  36.89 
 
 		 579 aa  349  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  35.08 
 
 		 579 aa  342  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  35.92 
 
 		 580 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  35.92 
 
 		 583 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  35.74 
 
 		 583 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  34.68 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  33.49 
 
 		 617 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  34.88 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  33.49 
 
 		 617 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  35.29 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  34.62 
 
 		 574 aa  323  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  34.5 
 
 		 574 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  35.14 
 
 		 618 aa  319  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  34.33 
 
 		 583 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  35.88 
 
 		 575 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  34.62 
 
 		 575 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  34.3 
 
 		 591 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  34.13 
 
 		 591 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  34.01 
 
 		 591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  33.96 
 
 		 591 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  33.9 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  32.82 
 
 		 608 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  34.8 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  33.87 
 
 		 612 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  34.35 
 
 		 613 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  33.61 
 
 		 617 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  31.62 
 
 		 612 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  33.86 
 
 		 596 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  33.39 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  31.43 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  29.95 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.31 
 
 		 607 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  29.98 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  29.64 
 
 		 609 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  27.94 
 
 		 597 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  27.24 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  25.75 
 
 		 612 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  30 
 
 		 593 aa  210  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  25.25 
 
 		 629 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 598 aa  203  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  27.47 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  27.47 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  25.09 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  24.91 
 
 		 578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  25.88 
 
 		 612 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.81 
 
 		 618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25.81 
 
 		 576 aa  153  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1045 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  31.02 
 
 		 1126 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  31.39 
 
 		 1113 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  25.65 
 
 		 618 aa  150  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  26.75 
 
 		 696 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.68 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  28.19 
 
 		 605 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  27.63 
 
 		 611 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  27.11 
 
 		 604 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 604 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 604 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 604 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  26.55 
 
 		 611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 591 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  27.85 
 
 		 611 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 601 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>