More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2434 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  70.69 
 
 		 583 aa  844    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  70.34 
 
 		 580 aa  838    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  72.26 
 
 		 574 aa  865    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  70.86 
 
 		 583 aa  843    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  72.44 
 
 		 574 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  100 
 
 		 575 aa  1154    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  70.09 
 
 		 575 aa  846    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  67.37 
 
 		 579 aa  777    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  65.23 
 
 		 555 aa  757    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  70.34 
 
 		 583 aa  832    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  67.72 
 
 		 579 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  46.89 
 
 		 582 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  44.11 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  42.34 
 
 		 573 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  37.12 
 
 		 573 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  35.64 
 
 		 578 aa  326  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  35.56 
 
 		 594 aa  326  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  35.14 
 
 		 573 aa  323  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  35.13 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  35.4 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  35.22 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  35.22 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  35.22 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  35.4 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  35.22 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  35.01 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  35.21 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  35.02 
 
 		 591 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  35.22 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  35.05 
 
 		 577 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  35.88 
 
 		 582 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  34.66 
 
 		 571 aa  313  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  36.26 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 611 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  34.02 
 
 		 577 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  34.02 
 
 		 577 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  34.02 
 
 		 577 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  34.02 
 
 		 577 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  34.02 
 
 		 577 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  34.49 
 
 		 571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  35.03 
 
 		 579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  34.02 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  33.28 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  34.14 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  34.14 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  34.14 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  32.62 
 
 		 621 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 591 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  32.33 
 
 		 618 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  31.48 
 
 		 617 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  31.48 
 
 		 617 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  32.2 
 
 		 596 aa  289  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 591 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  34.58 
 
 		 612 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 591 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  30.89 
 
 		 575 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  32.74 
 
 		 636 aa  286  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  34.16 
 
 		 613 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  31.91 
 
 		 608 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  33.53 
 
 		 612 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  32.66 
 
 		 609 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  28.35 
 
 		 588 aa  270  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  30.34 
 
 		 617 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  31.43 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  31.88 
 
 		 593 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  31.81 
 
 		 607 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  29.22 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  27.03 
 
 		 591 aa  224  4e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  29.03 
 
 		 578 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  29.37 
 
 		 598 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  31.02 
 
 		 584 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  31.38 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  31.2 
 
 		 597 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  29.76 
 
 		 603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  29.11 
 
 		 612 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 629 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  28.84 
 
 		 576 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  28.84 
 
 		 618 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  28.83 
 
 		 562 aa  191  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  28.83 
 
 		 562 aa  191  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  30.33 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1045 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  33.43 
 
 		 1126 aa  179  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  26.45 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  28.35 
 
 		 585 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  27.74 
 
 		 682 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  31.62 
 
 		 1113 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  28.09 
 
 		 611 aa  164  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  27.24 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 595 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.91 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  26.91 
 
 		 573 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  26.91 
 
 		 573 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  26.91 
 
 		 573 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.91 
 
 		 605 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 559 aa  160  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  26.72 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  26.36 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>