More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03724 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  100 
 
 
584 aa  1190    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  73.46 
 
 
598 aa  902    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  72.73 
 
 
612 aa  888    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  72.73 
 
 
629 aa  888    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  34.26 
 
 
573 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  31.2 
 
 
578 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  30.07 
 
 
588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  30.63 
 
 
571 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  31.65 
 
 
596 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  30.63 
 
 
571 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  32.3 
 
 
582 aa  248  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  29.28 
 
 
570 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  29.61 
 
 
591 aa  243  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  29.73 
 
 
578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  29.73 
 
 
578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  27.99 
 
 
573 aa  240  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  30.07 
 
 
558 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  29.73 
 
 
578 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  30.13 
 
 
577 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  30.13 
 
 
577 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  30.13 
 
 
577 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  30.13 
 
 
577 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  30.13 
 
 
577 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  30.13 
 
 
577 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  30.19 
 
 
577 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  30.13 
 
 
577 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  29.97 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  29.97 
 
 
577 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  31.08 
 
 
573 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  30.02 
 
 
577 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  29.85 
 
 
577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  29.85 
 
 
577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  29.85 
 
 
577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  29.85 
 
 
577 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  29.28 
 
 
575 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.39 
 
 
574 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  27.81 
 
 
570 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  31.61 
 
 
579 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  28.98 
 
 
594 aa  225  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  30.36 
 
 
574 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  30.02 
 
 
588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  31.23 
 
 
579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  30.51 
 
 
555 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  31.02 
 
 
575 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  31.59 
 
 
583 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  28.85 
 
 
636 aa  216  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  31.4 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  31.21 
 
 
580 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  27.24 
 
 
582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  28.7 
 
 
607 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  31.54 
 
 
583 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  27.54 
 
 
611 aa  211  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  29.23 
 
 
609 aa  209  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  25.99 
 
 
609 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  27.52 
 
 
612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  25.21 
 
 
578 aa  200  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  26.75 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  25.04 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  27.41 
 
 
617 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  26.95 
 
 
613 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  27.23 
 
 
612 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  26.22 
 
 
621 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  26.48 
 
 
617 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  26.48 
 
 
617 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  26.42 
 
 
591 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  26.06 
 
 
591 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  27.64 
 
 
593 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  26.06 
 
 
591 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  26.31 
 
 
617 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  26.31 
 
 
617 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  26.84 
 
 
579 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  26.15 
 
 
618 aa  187  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  26.46 
 
 
596 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.48 
 
 
603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  25.63 
 
 
591 aa  183  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  26.18 
 
 
575 aa  179  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  28.55 
 
 
612 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.04 
 
 
601 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.98 
 
 
597 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  28.62 
 
 
618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  27.31 
 
 
576 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  27.31 
 
 
618 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  27.42 
 
 
604 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  27.42 
 
 
604 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  26.03 
 
 
696 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  27.42 
 
 
604 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  26.63 
 
 
604 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  26.33 
 
 
595 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  25.69 
 
 
595 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  27.06 
 
 
605 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  27.04 
 
 
605 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  27.04 
 
 
605 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  25.77 
 
 
611 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  25.95 
 
 
611 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  26.81 
 
 
573 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  26.81 
 
 
573 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  26.81 
 
 
573 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.77 
 
 
611 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  25.95 
 
 
611 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.81 
 
 
571 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>