More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0459 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  71.45 
 
 		 577 aa  871    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  71.45 
 
 		 577 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  75.43 
 
 		 578 aa  932    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  72.49 
 
 		 577 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  70.76 
 
 		 577 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  67.81 
 
 		 591 aa  844    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  71.28 
 
 		 577 aa  869    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  71.45 
 
 		 577 aa  871    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  73.3 
 
 		 571 aa  872    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  71.45 
 
 		 577 aa  872    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  70.76 
 
 		 577 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  70.76 
 
 		 577 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  69.18 
 
 		 594 aa  830    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  70.76 
 
 		 577 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  71.11 
 
 		 577 aa  869    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  73.3 
 
 		 571 aa  869    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  100 
 
 		 578 aa  1184    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  71.45 
 
 		 577 aa  872    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  71.45 
 
 		 577 aa  871    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  71.45 
 
 		 577 aa  872    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  70.76 
 
 		 577 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  75.09 
 
 		 578 aa  927    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  75.43 
 
 		 578 aa  932    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  46.77 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  43.9 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  44.46 
 
 		 573 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  42.33 
 
 		 570 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  40.24 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  40.83 
 
 		 582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  38.98 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  37.48 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  38.35 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  35.95 
 
 		 575 aa  349  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  34.19 
 
 		 575 aa  346  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  34.78 
 
 		 579 aa  340  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  36.24 
 
 		 583 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  36.35 
 
 		 583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  33.8 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  35.64 
 
 		 575 aa  326  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  32.65 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  35.77 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  34.36 
 
 		 579 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  35.57 
 
 		 580 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  34.36 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  33.16 
 
 		 582 aa  321  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  34.29 
 
 		 555 aa  316  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  32.88 
 
 		 612 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  32.57 
 
 		 573 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  33.55 
 
 		 612 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  32.95 
 
 		 617 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  31.87 
 
 		 608 aa  293  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  32.24 
 
 		 596 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 617 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 617 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  32.66 
 
 		 596 aa  290  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  32.14 
 
 		 636 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  30.64 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  33.78 
 
 		 591 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  33.61 
 
 		 591 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  31.8 
 
 		 621 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  33.56 
 
 		 591 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  33.84 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  32.15 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  31.59 
 
 		 609 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  31.49 
 
 		 613 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  31.2 
 
 		 584 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.75 
 
 		 607 aa  253  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  31.21 
 
 		 593 aa  250  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  29.77 
 
 		 629 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  29.44 
 
 		 612 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  29.37 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  28.52 
 
 		 603 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  27.4 
 
 		 609 aa  206  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  27.84 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  25.09 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  24.74 
 
 		 578 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  26.03 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  26.03 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1769  hypothetical protein  26.19 
 
 		 562 aa  174  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1770  hypothetical protein  26.19 
 
 		 562 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  33.24 
 
 		 1045 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  27.13 
 
 		 612 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  32.95 
 
 		 1113 aa  154  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  32.01 
 
 		 1126 aa  153  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.92 
 
 		 591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 604 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 604 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  25.19 
 
 		 611 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  25.19 
 
 		 604 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.19 
 
 		 611 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  24.31 
 
 		 604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  24.91 
 
 		 605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  25.96 
 
 		 611 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  24.71 
 
 		 682 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  25.67 
 
 		 696 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  25.83 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 589 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  25.47 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>