278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1510 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  100 
 
 		 1045 aa  2127    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  92.78 
 
 		 1126 aa  1783    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  53.33 
 
 		 1113 aa  988    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  35.88 
 
 		 558 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  33.71 
 
 		 555 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  35.14 
 
 		 582 aa  190  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  34.2 
 
 		 579 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  33.91 
 
 		 579 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  33.81 
 
 		 574 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  34.38 
 
 		 583 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  34.38 
 
 		 583 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  33.81 
 
 		 574 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  34.38 
 
 		 580 aa  186  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  34.49 
 
 		 575 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  33.81 
 
 		 583 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  34.73 
 
 		 573 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  33.43 
 
 		 575 aa  180  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 		 578 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  33.05 
 
 		 593 aa  159  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 578 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  33.14 
 
 		 579 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  33.99 
 
 		 573 aa  158  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  33.05 
 
 		 578 aa  156  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  33.24 
 
 		 578 aa  155  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  30.75 
 
 		 582 aa  153  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  32.38 
 
 		 577 aa  151  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  31.17 
 
 		 570 aa  151  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  33.62 
 
 		 611 aa  150  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  32.01 
 
 		 570 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  32.49 
 
 		 571 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  32.28 
 
 		 577 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  31.99 
 
 		 577 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  31.99 
 
 		 577 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  31.99 
 
 		 577 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 596 aa  147  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  31.99 
 
 		 577 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  32.58 
 
 		 571 aa  147  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  31.48 
 
 		 573 aa  146  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  32.53 
 
 		 591 aa  145  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  31.41 
 
 		 577 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  31.46 
 
 		 588 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  31.41 
 
 		 577 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  31.41 
 
 		 577 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  32.83 
 
 		 594 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  31.41 
 
 		 577 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  31.41 
 
 		 577 aa  141  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  31.41 
 
 		 577 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  31.7 
 
 		 577 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  31.7 
 
 		 577 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 575 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  31.12 
 
 		 577 aa  137  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 596 aa  135  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  30.1 
 
 		 636 aa  134  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  32.08 
 
 		 607 aa  134  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  33.06 
 
 		 617 aa  131  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  28.69 
 
 		 609 aa  128  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  29.27 
 
 		 608 aa  125  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  31.95 
 
 		 612 aa  124  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  29.97 
 
 		 598 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  27.45 
 
 		 588 aa  119  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  33.55 
 
 		 613 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  27.7 
 
 		 617 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  27.7 
 
 		 617 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 617 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  28.13 
 
 		 612 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  27.05 
 
 		 629 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  30.11 
 
 		 612 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 617 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  29.72 
 
 		 584 aa  115  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  29.89 
 
 		 585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  37.38 
 
 		 618 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 621 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  29.86 
 
 		 591 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  36.89 
 
 		 591 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  32.04 
 
 		 591 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  32.29 
 
 		 585 aa  112  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  35.59 
 
 		 591 aa  107  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  30.56 
 
 		 597 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  28.2 
 
 		 595 aa  101  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  28.2 
 
 		 595 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 612 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  25.34 
 
 		 578 aa  98.2  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  29.72 
 
 		 601 aa  97.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  28.46 
 
 		 640 aa  97.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  25.34 
 
 		 578 aa  97.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 603 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  45.3 
 
 		 648 aa  96.3  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  28.73 
 
 		 618 aa  95.9  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  33.5 
 
 		 646 aa  94.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  27.7 
 
 		 589 aa  93.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  27.46 
 
 		 696 aa  93.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.21 
 
 		 609 aa  93.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  34.81 
 
 		 559 aa  92.8  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 621 aa  92.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  25.5 
 
 		 629 aa  90.5  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 634 aa  90.1  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  32.04 
 
 		 677 aa  89  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 634 aa  89  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 643 aa  88.2  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 610 aa  87.8  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>