More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1592 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  100 
 
 		 621 aa  1235    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  54.42 
 
 		 651 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  53.39 
 
 		 665 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  48.89 
 
 		 643 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  49.48 
 
 		 629 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  51.03 
 
 		 636 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  47.08 
 
 		 640 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  46.79 
 
 		 634 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  46.62 
 
 		 634 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  36.5 
 
 		 648 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  34 
 
 		 646 aa  316  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  33.11 
 
 		 604 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  30.78 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  32.25 
 
 		 604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  32.25 
 
 		 604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  32.82 
 
 		 604 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  32.09 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  31.69 
 
 		 611 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  31.53 
 
 		 611 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  32.7 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  32.7 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  33.05 
 
 		 573 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  33.05 
 
 		 573 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  33.05 
 
 		 573 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  33.05 
 
 		 605 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  32.3 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  33 
 
 		 682 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  35.77 
 
 		 585 aa  272  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  30.49 
 
 		 595 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 595 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  31.62 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  33.68 
 
 		 585 aa  265  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 589 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  31.47 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  30.47 
 
 		 612 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  30.53 
 
 		 611 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 696 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  30.99 
 
 		 559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  29.29 
 
 		 618 aa  227  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.95 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  27.07 
 
 		 575 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 583 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  27.55 
 
 		 579 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 580 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 583 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.98 
 
 		 579 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.73 
 
 		 583 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.32 
 
 		 607 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.26 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.47 
 
 		 596 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.98 
 
 		 574 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.93 
 
 		 575 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26.48 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 597 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  26.42 
 
 		 588 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.52 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.32 
 
 		 601 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  28.49 
 
 		 558 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 598 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.81 
 
 		 609 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  24.66 
 
 		 609 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.27 
 
 		 584 aa  124  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  25.72 
 
 		 593 aa  124  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  24.73 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25.32 
 
 		 591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  22.28 
 
 		 629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.64 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.64 
 
 		 618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  23.84 
 
 		 617 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  23.13 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1616  hypothetical protein  25.89 
 
 		 612 aa  113  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.254318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  24.54 
 
 		 618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.45 
 
 		 570 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  24.33 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  21.74 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  24.15 
 
 		 577 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  24.15 
 
 		 577 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  22.33 
 
 		 578 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  24.15 
 
 		 577 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  24.15 
 
 		 577 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  22.6 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  23.7 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  23.7 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  23.7 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  23.7 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  23.34 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  25.15 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  29.62 
 
 		 1126 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  23.16 
 
 		 577 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  23.16 
 
 		 577 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  23.16 
 
 		 577 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1045 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  40 
 
 		 579 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  41.61 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  21.92 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.12 
 
 		 610 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 622 aa  91.3  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1607  surface antigen (D15)  26.39 
 
 		 1113 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  26.23 
 
 		 622 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>