More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1090 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1293    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  44.92 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  37.35 
 
 		 629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  37.27 
 
 		 665 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  35.32 
 
 		 643 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  36.61 
 
 		 634 aa  327  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  36.44 
 
 		 634 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  37.26 
 
 		 651 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  36.52 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  35.4 
 
 		 636 aa  310  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  34.89 
 
 		 604 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  33.6 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  34.84 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  34.84 
 
 		 573 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  34.84 
 
 		 573 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  34.84 
 
 		 573 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  34.84 
 
 		 605 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  33.23 
 
 		 611 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  34.84 
 
 		 605 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  34.72 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  34.54 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  33.39 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  34.54 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  34.67 
 
 		 605 aa  298  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  33.62 
 
 		 682 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  34.43 
 
 		 611 aa  293  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  33.28 
 
 		 591 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  33.85 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  31.44 
 
 		 640 aa  275  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  37.11 
 
 		 585 aa  271  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  32.59 
 
 		 612 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  32.54 
 
 		 589 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  31.67 
 
 		 595 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  31.67 
 
 		 595 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  35.13 
 
 		 585 aa  261  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  30.21 
 
 		 696 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  33.1 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  32.93 
 
 		 601 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  32.03 
 
 		 559 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  29.91 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 593 aa  178  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  27.14 
 
 		 588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 611 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  27.51 
 
 		 596 aa  168  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  28.95 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  29.83 
 
 		 579 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25.78 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 618 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.51 
 
 		 607 aa  157  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.47 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.86 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  28.2 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  27.68 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  27.68 
 
 		 583 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  28.42 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  27.49 
 
 		 580 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  27.68 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.63 
 
 		 574 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 601 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  27.16 
 
 		 603 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  27.42 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  26.03 
 
 		 578 aa  142  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  25.05 
 
 		 578 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 597 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  25.85 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  28.19 
 
 		 584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  26.65 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  27.52 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 571 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  25.64 
 
 		 612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  27.24 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  27.24 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  27.24 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  27.24 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  27.24 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  26.48 
 
 		 591 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.62 
 
 		 570 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  28.16 
 
 		 582 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  27 
 
 		 594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.93 
 
 		 571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 629 aa  128  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  26.09 
 
 		 596 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  27.07 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 636 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  26.71 
 
 		 612 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  26.89 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  27.07 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  26.89 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  26.89 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  26.89 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  24.5 
 
 		 575 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  26.89 
 
 		 577 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  26.89 
 
 		 577 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  26.89 
 
 		 577 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 577 aa  124  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  25.04 
 
 		 573 aa  123  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 617 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  28.32 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>