More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3560 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  55.02 
 
 		 640 aa  680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  69.23 
 
 		 629 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  60.44 
 
 		 636 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  55.97 
 
 		 643 aa  686    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  99.53 
 
 		 634 aa  1268    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  100 
 
 		 634 aa  1272    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  46.62 
 
 		 651 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  47.9 
 
 		 665 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  47.5 
 
 		 621 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  36.44 
 
 		 648 aa  323  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  33.96 
 
 		 646 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  31.58 
 
 		 611 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  31.58 
 
 		 611 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  31.73 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  33.63 
 
 		 601 aa  267  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  31.23 
 
 		 604 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  31.63 
 
 		 605 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  31.9 
 
 		 611 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  30.7 
 
 		 604 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  30.7 
 
 		 604 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  30.7 
 
 		 604 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  31.05 
 
 		 571 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  31.82 
 
 		 612 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  31.05 
 
 		 605 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  31.05 
 
 		 605 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  30.88 
 
 		 573 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  30.88 
 
 		 573 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  30.88 
 
 		 573 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  30.25 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  30.88 
 
 		 605 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  31.52 
 
 		 682 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  33.16 
 
 		 589 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 595 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  31.49 
 
 		 595 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  34.58 
 
 		 585 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 696 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  33.21 
 
 		 559 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  33.9 
 
 		 585 aa  232  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  30.17 
 
 		 618 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.12 
 
 		 573 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  27.68 
 
 		 579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  27.83 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  27.83 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 596 aa  144  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  26.3 
 
 		 583 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  26.12 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.06 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.7 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 580 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25.18 
 
 		 597 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  24.96 
 
 		 578 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  25.94 
 
 		 570 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  24.79 
 
 		 578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  24.79 
 
 		 578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 607 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.28 
 
 		 607 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  26.86 
 
 		 611 aa  127  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.23 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  24.91 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28.39 
 
 		 607 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 558 aa  124  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 596 aa  124  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.73 
 
 		 574 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 571 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.67 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  24.75 
 
 		 578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  24.69 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 627 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  25.62 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 577 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.77 
 
 		 576 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  24.77 
 
 		 618 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  22.72 
 
 		 578 aa  113  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  24.32 
 
 		 612 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.78 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.78 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.61 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.78 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  22.52 
 
 		 578 aa  112  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 617 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 617 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  23.73 
 
 		 618 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  23.26 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  21.11 
 
 		 575 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  23.26 
 
 		 577 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  23.26 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  23.26 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  23.25 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  23.26 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  23.26 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>