More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1182 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  100 
 
 		 607 aa  1192    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  84.68 
 
 		 627 aa  1030    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  99.84 
 
 		 607 aa  1190    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  44.66 
 
 		 627 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  42.41 
 
 		 598 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  40 
 
 		 610 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  39.45 
 
 		 594 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  37.23 
 
 		 643 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  35.32 
 
 		 671 aa  318  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  34.64 
 
 		 639 aa  309  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  34.47 
 
 		 639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.96 
 
 		 653 aa  301  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.88 
 
 		 637 aa  250  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  31.25 
 
 		 620 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  31.06 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  30 
 
 		 622 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  31.34 
 
 		 653 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 665 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  30.32 
 
 		 653 aa  199  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  29.15 
 
 		 663 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.71 
 
 		 661 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  28.06 
 
 		 661 aa  194  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 661 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  32.11 
 
 		 702 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.85 
 
 		 595 aa  180  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  28.92 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  31.58 
 
 		 615 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  31.51 
 
 		 632 aa  177  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  27.21 
 
 		 652 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 674 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  27.97 
 
 		 677 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.09 
 
 		 647 aa  153  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  26.82 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  31.66 
 
 		 776 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  29.47 
 
 		 629 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.45 
 
 		 633 aa  143  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  28.81 
 
 		 709 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  28.9 
 
 		 670 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  27.19 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.7 
 
 		 789 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  28.75 
 
 		 634 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  28.39 
 
 		 634 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 610 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 779 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 571 aa  113  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 636 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.37 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  25.87 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.29 
 
 		 793 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.25 
 
 		 806 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.9 
 
 		 793 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 820 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.39 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.8 
 
 		 751 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  29.08 
 
 		 601 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  26.65 
 
 		 559 aa  94.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 583 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  26.47 
 
 		 585 aa  92  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.77 
 
 		 607 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.9 
 
 		 767 aa  91.3  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.39 
 
 		 583 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  26.63 
 
 		 785 aa  90.1  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23.23 
 
 		 583 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.76 
 
 		 770 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.75 
 
 		 585 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.63 
 
 		 579 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.16 
 
 		 579 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.86 
 
 		 770 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.87 
 
 		 770 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  22.96 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.74 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.85 
 
 		 895 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  25.95 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  22.73 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  21.51 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.29 
 
 		 759 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 		 769 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  22.99 
 
 		 578 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.51 
 
 		 765 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.14 
 
 		 765 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  25.31 
 
 		 765 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.3 
 
 		 769 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  23.69 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.2 
 
 		 768 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  23.1 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  25.58 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  23.1 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  26.1 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  20.92 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.8 
 
 		 765 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 677 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.41 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 		 769 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 		 769 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 		 768 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 		 768 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 		 768 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>