More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0048 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  100 
 
 
639 aa  1290    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  99.84 
 
 
639 aa  1288    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  53.59 
 
 
643 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  89.83 
 
 
671 aa  1154    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  48.49 
 
 
653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  38.57 
 
 
622 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  38.41 
 
 
622 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  40 
 
 
620 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  37.29 
 
 
637 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  37.96 
 
 
653 aa  364  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  35.49 
 
 
627 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  37.77 
 
 
627 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  35.89 
 
 
594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  35.09 
 
 
663 aa  330  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.21 
 
 
665 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  34.81 
 
 
607 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  34.45 
 
 
653 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  36.36 
 
 
610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  34.64 
 
 
607 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  34.18 
 
 
598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  32.88 
 
 
677 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  32.88 
 
 
661 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  32.25 
 
 
661 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  32.2 
 
 
661 aa  282  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  31.18 
 
 
652 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.37 
 
 
595 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.21 
 
 
647 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.08 
 
 
702 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.8 
 
 
595 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.33 
 
 
776 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  30.53 
 
 
615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  29.31 
 
 
674 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  29.07 
 
 
633 aa  203  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  27.18 
 
 
588 aa  203  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.81 
 
 
571 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  29.55 
 
 
632 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  28.1 
 
 
789 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  29.68 
 
 
779 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  26.96 
 
 
613 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  27.7 
 
 
709 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  25.97 
 
 
593 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  27.35 
 
 
670 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.52 
 
 
610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.31 
 
 
583 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.31 
 
 
583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.9 
 
 
579 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.62 
 
 
579 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.27 
 
 
657 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.78 
 
 
580 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  27.09 
 
 
677 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  25.65 
 
 
629 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  27.09 
 
 
677 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.26 
 
 
575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.39 
 
 
583 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  24.79 
 
 
640 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.68 
 
 
574 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  24.68 
 
 
636 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  24.74 
 
 
646 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  25.27 
 
 
588 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  25.56 
 
 
558 aa  105  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.45 
 
 
793 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  24.88 
 
 
618 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.88 
 
 
576 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  27.59 
 
 
559 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.76 
 
 
574 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  24.81 
 
 
611 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  23.16 
 
 
555 aa  100  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  24.67 
 
 
618 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.05 
 
 
806 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.85 
 
 
793 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.34 
 
 
585 aa  99  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  24.47 
 
 
598 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
564 aa  98.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
643 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  23.65 
 
 
575 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  22.98 
 
 
582 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  25.1 
 
 
621 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  23.38 
 
 
779 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.25 
 
 
820 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  24.95 
 
 
593 aa  95.9  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  23.99 
 
 
577 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  23.99 
 
 
577 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  23.99 
 
 
577 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  23.99 
 
 
577 aa  94.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  26.19 
 
 
611 aa  94  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  23.74 
 
 
682 aa  93.2  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  23.99 
 
 
577 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.34 
 
 
605 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  23.99 
 
 
577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  23.83 
 
 
634 aa  92.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.75 
 
 
913 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  23.99 
 
 
577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.43 
 
 
573 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  23.99 
 
 
577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  26.19 
 
 
611 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26.98 
 
 
835 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  23.99 
 
 
577 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  24.29 
 
 
651 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  25.71 
 
 
601 aa  91.3  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  25.18 
 
 
577 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>