More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4827 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  100 
 
 		 670 aa  1338    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  44.15 
 
 		 709 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  45.27 
 
 		 779 aa  452  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  34.56 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.16 
 
 		 702 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  31.92 
 
 		 615 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  31.68 
 
 		 789 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  30.09 
 
 		 595 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  33.19 
 
 		 776 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  30.98 
 
 		 663 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  30.07 
 
 		 622 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  30.11 
 
 		 622 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  30.51 
 
 		 665 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  31.59 
 
 		 647 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.99 
 
 		 571 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 677 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  30.86 
 
 		 593 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.06 
 
 		 637 aa  205  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  29.26 
 
 		 588 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  30.13 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  29.75 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  28.11 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  32.16 
 
 		 653 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.12 
 
 		 661 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  29.36 
 
 		 674 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 661 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  32.92 
 
 		 633 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  27.64 
 
 		 661 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  29.51 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 652 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.96 
 
 		 610 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  29.36 
 
 		 671 aa  163  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  29.11 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28.9 
 
 		 607 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  27.35 
 
 		 639 aa  157  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  27.18 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  29.05 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 627 aa  150  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  28.04 
 
 		 575 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  25.64 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 610 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  30.04 
 
 		 643 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.81 
 
 		 597 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.91 
 
 		 575 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  28.32 
 
 		 609 aa  140  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  41.67 
 
 		 653 aa  139  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.02 
 
 		 574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 555 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  27.12 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.44 
 
 		 574 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.33 
 
 		 596 aa  133  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  25.49 
 
 		 607 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.58 
 
 		 895 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.1 
 
 		 603 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.14 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.31 
 
 		 573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 677 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.95 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 677 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.89 
 
 		 605 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.71 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  26.22 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  26.09 
 
 		 580 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  26.03 
 
 		 583 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  26.13 
 
 		 611 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.03 
 
 		 657 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  25.93 
 
 		 578 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 604 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.94 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 604 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  24.77 
 
 		 604 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26.66 
 
 		 835 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  26.14 
 
 		 578 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 611 aa  120  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  26.14 
 
 		 578 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.47 
 
 		 583 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.64 
 
 		 605 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.45 
 
 		 605 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.45 
 
 		 571 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  25.99 
 
 		 573 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  25.99 
 
 		 573 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  25.99 
 
 		 573 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.58 
 
 		 892 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  26.07 
 
 		 594 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  24.91 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  25.8 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  23.43 
 
 		 571 aa  115  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  26.13 
 
 		 629 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  24.27 
 
 		 594 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.88 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  25.75 
 
 		 682 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  24.11 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.7 
 
 		 808 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  25.45 
 
 		 601 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  25.28 
 
 		 611 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>