More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1716 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  100 
 
 		 653 aa  1323    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  53.01 
 
 		 653 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  42.65 
 
 		 665 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  41.93 
 
 		 663 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  37.89 
 
 		 661 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  38.14 
 
 		 661 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  39.24 
 
 		 661 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  39.93 
 
 		 652 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  37.69 
 
 		 677 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  36.23 
 
 		 674 aa  342  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  35.41 
 
 		 671 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  34.45 
 
 		 620 aa  322  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  34.45 
 
 		 639 aa  321  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  34.29 
 
 		 639 aa  319  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  32.79 
 
 		 622 aa  316  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  34.67 
 
 		 643 aa  313  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  32.31 
 
 		 622 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  34.06 
 
 		 637 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.28 
 
 		 653 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  33.66 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  32.78 
 
 		 632 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  27.95 
 
 		 702 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  33.91 
 
 		 776 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.43 
 
 		 595 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  31.29 
 
 		 627 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  28.84 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  30.71 
 
 		 594 aa  220  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  30.21 
 
 		 789 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  31.4 
 
 		 607 aa  217  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  31.22 
 
 		 607 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.55 
 
 		 633 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 593 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  29.82 
 
 		 627 aa  210  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  30 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  32.88 
 
 		 779 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  32.85 
 
 		 670 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  29.14 
 
 		 571 aa  193  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  29.27 
 
 		 613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.56 
 
 		 595 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  29.97 
 
 		 598 aa  183  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  27.63 
 
 		 709 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  27.05 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.62 
 
 		 610 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 677 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.44 
 
 		 677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  25.6 
 
 		 657 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 888 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  23.63 
 
 		 575 aa  113  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  23.77 
 
 		 555 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  25.43 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 582 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.22 
 
 		 583 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  24.25 
 
 		 798 aa  108  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 		 780 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  22.18 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.27 
 
 		 583 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  22.41 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.13 
 
 		 607 aa  104  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 601 aa  103  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.63 
 
 		 583 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 559 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  23.77 
 
 		 609 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.18 
 
 		 769 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.01 
 
 		 778 aa  99.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0699  surface antigen (D15)  23.44 
 
 		 1083 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.208817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  24.05 
 
 		 777 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  21.89 
 
 		 564 aa  98.2  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  21.97 
 
 		 760 aa  98.2  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  23.7 
 
 		 785 aa  98.2  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.33 
 
 		 574 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.44 
 
 		 790 aa  97.4  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 		 779 aa  97.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.35 
 
 		 768 aa  97.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.65 
 
 		 770 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 768 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  23.86 
 
 		 1002 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.71 
 
 		 913 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 768 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 835 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.56 
 
 		 769 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 769 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  22.4 
 
 		 576 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 769 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 769 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 768 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 769 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  24.37 
 
 		 611 aa  96.3  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 768 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 768 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.21 
 
 		 768 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  22.4 
 
 		 618 aa  95.5  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.56 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.56 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.72 
 
 		 574 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.55 
 
 		 767 aa  95.1  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  24.26 
 
 		 705 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  22.92 
 
 		 779 aa  94.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  23.92 
 
 		 820 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>