More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2887 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  100 
 
 		 637 aa  1266    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  60 
 
 		 620 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  63.02 
 
 		 622 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  63.18 
 
 		 622 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  40.63 
 
 		 643 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  38.69 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  37.29 
 
 		 639 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  37.13 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  35.73 
 
 		 653 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.56 
 
 		 653 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  34.4 
 
 		 653 aa  303  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  34.72 
 
 		 663 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  32.86 
 
 		 677 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.5 
 
 		 665 aa  290  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  34.71 
 
 		 661 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  34.63 
 
 		 661 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  34.79 
 
 		 661 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  33.86 
 
 		 652 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  35.27 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  34.12 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  33.94 
 
 		 607 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  31.52 
 
 		 598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  31.71 
 
 		 627 aa  244  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  32.49 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  32.76 
 
 		 615 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  30.35 
 
 		 674 aa  236  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  32.12 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  29.25 
 
 		 702 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.7 
 
 		 647 aa  219  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.12 
 
 		 595 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  31.81 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.05 
 
 		 776 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.6 
 
 		 789 aa  207  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.42 
 
 		 633 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  31.37 
 
 		 670 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.85 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  29.47 
 
 		 709 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  28.33 
 
 		 595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  27.52 
 
 		 613 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 779 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 610 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.95 
 
 		 579 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.07 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.55 
 
 		 579 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 555 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.34 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.93 
 
 		 607 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 583 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  22.02 
 
 		 583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  23.52 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  22.06 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.74 
 
 		 574 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  22.42 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  25.56 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  25.77 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  25.56 
 
 		 571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  25.94 
 
 		 784 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  25.2 
 
 		 575 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  25.36 
 
 		 573 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  25.36 
 
 		 573 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  25.36 
 
 		 573 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 765 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  25.15 
 
 		 682 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  25.15 
 
 		 605 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.68 
 
 		 772 aa  111  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 768 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 768 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.2 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 768 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 768 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 769 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 769 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  24.48 
 
 		 769 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  24.29 
 
 		 768 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.73 
 
 		 913 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.15 
 
 		 888 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.14 
 
 		 767 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.27 
 
 		 770 aa  107  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.51 
 
 		 760 aa  107  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  26.19 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.9 
 
 		 770 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.92 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.72 
 
 		 920 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.92 
 
 		 769 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 769 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 578 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.54 
 
 		 769 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 677 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 769 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 769 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.12 
 
 		 677 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.12 
 
 		 806 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.93 
 
 		 793 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>