More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2621 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  84.68 
 
 		 607 aa  989    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  100 
 
 		 627 aa  1241    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  84.68 
 
 		 607 aa  988    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  45.6 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  45.25 
 
 		 598 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  38.66 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  38.33 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  36.7 
 
 		 643 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  36.01 
 
 		 671 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  35.49 
 
 		 639 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  35.32 
 
 		 639 aa  326  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  30.58 
 
 		 653 aa  290  7e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  31.71 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  31.98 
 
 		 620 aa  229  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  29.97 
 
 		 622 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 622 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  30.92 
 
 		 653 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  31.29 
 
 		 653 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  31.53 
 
 		 663 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  30.6 
 
 		 665 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  28.4 
 
 		 661 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  28.32 
 
 		 661 aa  194  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  30.36 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 588 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  31.68 
 
 		 615 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 702 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.99 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  28.34 
 
 		 652 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  28.01 
 
 		 677 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  33.4 
 
 		 632 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 674 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 647 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 776 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  27.01 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 633 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  28.96 
 
 		 629 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.05 
 
 		 670 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  26.09 
 
 		 593 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 709 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 779 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  27.16 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.63 
 
 		 610 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 634 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  28.44 
 
 		 789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.83 
 
 		 575 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  28.23 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.64 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.05 
 
 		 583 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  26.13 
 
 		 636 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23.71 
 
 		 583 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.71 
 
 		 580 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  26.95 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 601 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  27.15 
 
 		 835 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.95 
 
 		 607 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 555 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.44 
 
 		 751 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.49 
 
 		 820 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  26.36 
 
 		 605 aa  94.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  25.89 
 
 		 604 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  22.91 
 
 		 582 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  26.43 
 
 		 585 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.52 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  26.88 
 
 		 682 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.66 
 
 		 765 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  26.35 
 
 		 559 aa  92  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  25.72 
 
 		 604 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  25.72 
 
 		 604 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  26.1 
 
 		 604 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  23.21 
 
 		 646 aa  90.9  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  25.55 
 
 		 611 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.44 
 
 		 793 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.84 
 
 		 770 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.05 
 
 		 793 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.46 
 
 		 806 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 573 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.91 
 
 		 577 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  24.6 
 
 		 612 aa  88.6  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 573 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 571 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 573 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  23.41 
 
 		 579 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.55 
 
 		 611 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 605 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 605 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 		 605 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  23.13 
 
 		 575 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.91 
 
 		 577 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  25.32 
 
 		 578 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  26 
 
 		 578 aa  87.8  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.91 
 
 		 577 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  25.32 
 
 		 578 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.75 
 
 		 577 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.75 
 
 		 577 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.72 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.12 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.93 
 
 		 767 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 618 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  25 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>