More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0465 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  100 
 
 		 702 aa  1414    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  37.29 
 
 		 776 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  39.53 
 
 		 789 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  34.57 
 
 		 632 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  31.56 
 
 		 665 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  33.81 
 
 		 615 aa  265  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  32.07 
 
 		 663 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  31.5 
 
 		 588 aa  259  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  33.13 
 
 		 661 aa  257  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  32.98 
 
 		 661 aa  258  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  30.85 
 
 		 595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  30.7 
 
 		 622 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  30.52 
 
 		 622 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  32.72 
 
 		 661 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  29.98 
 
 		 620 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  30.29 
 
 		 643 aa  240  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.76 
 
 		 779 aa  237  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  31.41 
 
 		 593 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  30.55 
 
 		 652 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  30.16 
 
 		 670 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  28.42 
 
 		 653 aa  229  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  30.34 
 
 		 637 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  30.44 
 
 		 613 aa  220  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  30.23 
 
 		 639 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  30.08 
 
 		 639 aa  216  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  29.22 
 
 		 677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  28.76 
 
 		 653 aa  213  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 671 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  27.86 
 
 		 653 aa  205  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  30.23 
 
 		 709 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  30.04 
 
 		 674 aa  193  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  31.89 
 
 		 607 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  31.69 
 
 		 607 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  27.11 
 
 		 647 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  28.49 
 
 		 571 aa  184  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 627 aa  177  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  28.96 
 
 		 610 aa  174  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  27.67 
 
 		 633 aa  173  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  29.12 
 
 		 595 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 610 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  24.96 
 
 		 594 aa  165  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 627 aa  146  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  28.4 
 
 		 607 aa  135  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.21 
 
 		 575 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  25.16 
 
 		 598 aa  128  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 578 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  25.96 
 
 		 558 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  22.99 
 
 		 575 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  23.76 
 
 		 579 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.33 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  24.89 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  22.52 
 
 		 588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  23.64 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  24.44 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  24.6 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  24.44 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  24.44 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  24.44 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  24.44 
 
 		 577 aa  111  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.88 
 
 		 583 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.42 
 
 		 577 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.58 
 
 		 577 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  22.49 
 
 		 582 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  24.28 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.42 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.42 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.84 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.42 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  24.28 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.55 
 
 		 768 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  24.8 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  25.4 
 
 		 612 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 609 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.95 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.75 
 
 		 769 aa  108  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 577 aa  108  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.09 
 
 		 583 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 597 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.54 
 
 		 770 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0606  OMP85 family outer membrane protein  23.06 
 
 		 591 aa  107  6e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.390129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 		 769 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  25.58 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 769 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.35 
 
 		 769 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 768 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.8 
 
 		 769 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  23 
 
 		 682 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 769 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 769 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 591 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.64 
 
 		 603 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 601 aa  105  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  24.74 
 
 		 591 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  25.27 
 
 		 702 aa  104  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.88 
 
 		 580 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 594 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.44 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.94 
 
 		 895 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.75 
 
 		 605 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>