More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1521 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  53.59 
 
 
639 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  53.58 
 
 
671 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  53.43 
 
 
639 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  100 
 
 
643 aa  1270    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  42.31 
 
 
653 aa  519  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  39.12 
 
 
622 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  38.61 
 
 
622 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  40.63 
 
 
637 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  38.03 
 
 
620 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  38.18 
 
 
653 aa  349  7e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  36.7 
 
 
627 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  37.23 
 
 
607 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  37.06 
 
 
607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.98 
 
 
665 aa  324  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  36.35 
 
 
594 aa  323  8e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  35.19 
 
 
627 aa  320  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  34.72 
 
 
663 aa  316  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  35.21 
 
 
652 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  33.78 
 
 
661 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  35.13 
 
 
598 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  33.03 
 
 
661 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  34.67 
 
 
653 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  32.33 
 
 
677 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  32.58 
 
 
661 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  33.51 
 
 
610 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  31.5 
 
 
674 aa  234  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.75 
 
 
647 aa  231  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.86 
 
 
702 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  33.76 
 
 
776 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  31.04 
 
 
632 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.67 
 
 
595 aa  204  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  29.39 
 
 
588 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  34.19 
 
 
615 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  29.73 
 
 
593 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.62 
 
 
595 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.15 
 
 
633 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  26.12 
 
 
613 aa  177  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.02 
 
 
571 aa  173  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  27.19 
 
 
789 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.7 
 
 
610 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  29.11 
 
 
709 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  29.87 
 
 
779 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  30.04 
 
 
670 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.3 
 
 
770 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.68 
 
 
583 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
583 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.19 
 
 
579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.08 
 
 
580 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23.73 
 
 
583 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.97 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  28.79 
 
 
835 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  29.28 
 
 
657 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.48 
 
 
574 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.03 
 
 
574 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  25 
 
 
618 aa  101  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  29.07 
 
 
677 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  28.85 
 
 
677 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.11 
 
 
913 aa  100  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.15 
 
 
607 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.64 
 
 
555 aa  97.8  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  26.02 
 
 
673 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  27.9 
 
 
585 aa  94.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  25.15 
 
 
588 aa  92  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.11 
 
 
770 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.55 
 
 
582 aa  92  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  24.6 
 
 
577 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  24.6 
 
 
577 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  24.38 
 
 
577 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.55 
 
 
769 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  24.38 
 
 
577 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  23.11 
 
 
578 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  24.15 
 
 
577 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.56 
 
 
585 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  23.64 
 
 
765 aa  88.6  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.64 
 
 
765 aa  88.2  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.52 
 
 
609 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.89 
 
 
576 aa  87.8  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  24.65 
 
 
779 aa  87  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  24.89 
 
 
618 aa  87.4  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.27 
 
 
751 aa  87  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  25.16 
 
 
767 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  34.03 
 
 
588 aa  86.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  23.38 
 
 
888 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  23.68 
 
 
575 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  24.15 
 
 
766 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.12 
 
 
752 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.62 
 
 
752 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  24 
 
 
765 aa  85.5  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.89 
 
 
770 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  25.58 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 
770 aa  85.1  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  25.58 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  25.58 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  37.96 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  25.58 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  24.09 
 
 
768 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  24.09 
 
 
769 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  24.09 
 
 
769 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  25.35 
 
 
577 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
769 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>