More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0433 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  100 
 
 		 595 aa  1203    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  35.08 
 
 		 588 aa  364  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  36.09 
 
 		 615 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  36.07 
 
 		 632 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  32.07 
 
 		 613 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  33.86 
 
 		 593 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  29.62 
 
 		 663 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  31.96 
 
 		 789 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.39 
 
 		 647 aa  253  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  29.53 
 
 		 665 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.33 
 
 		 702 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  28.75 
 
 		 661 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  35.63 
 
 		 776 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  30.36 
 
 		 671 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  28.35 
 
 		 661 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  28.35 
 
 		 652 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.03 
 
 		 661 aa  229  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 622 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 622 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  29.37 
 
 		 639 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  29.2 
 
 		 639 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.19 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 595 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  29.1 
 
 		 653 aa  213  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 677 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 653 aa  210  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  29.43 
 
 		 653 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.35 
 
 		 610 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  29.29 
 
 		 637 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  28.67 
 
 		 643 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  30.28 
 
 		 670 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 674 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  27.63 
 
 		 620 aa  193  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  30.11 
 
 		 607 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  29.93 
 
 		 607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  27.87 
 
 		 627 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 709 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  28.75 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 610 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  29.35 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  27.82 
 
 		 627 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  25.9 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  28.55 
 
 		 594 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 609 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.87 
 
 		 555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  24.67 
 
 		 596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.15 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.65 
 
 		 583 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  23.63 
 
 		 579 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  23.63 
 
 		 579 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.91 
 
 		 573 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23.46 
 
 		 583 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 601 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  23.64 
 
 		 575 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.53 
 
 		 580 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  25.1 
 
 		 575 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25 
 
 		 603 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 583 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.82 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.86 
 
 		 607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 597 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  22.93 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 		 793 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  22.44 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.1 
 
 		 806 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  24.62 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 		 793 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  24.45 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  24.45 
 
 		 577 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  24.45 
 
 		 577 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  24.45 
 
 		 577 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.98 
 
 		 751 aa  124  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  23.8 
 
 		 601 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25 
 
 		 765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.04 
 
 		 820 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 577 aa  122  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.74 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  25.42 
 
 		 577 aa  122  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  25.42 
 
 		 577 aa  122  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  25.42 
 
 		 577 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  27.07 
 
 		 573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  25.25 
 
 		 577 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  25.25 
 
 		 577 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.19 
 
 		 657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  26.05 
 
 		 629 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  26.05 
 
 		 612 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  25.25 
 
 		 577 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  25.36 
 
 		 779 aa  120  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.69 
 
 		 571 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  23.78 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  25.25 
 
 		 577 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  26.61 
 
 		 584 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.64 
 
 		 765 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.86 
 
 		 760 aa  118  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 677 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.69 
 
 		 571 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>