More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3626 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  59.42 
 
 		 620 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  94.05 
 
 		 622 aa  1180    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  63.02 
 
 		 637 aa  764    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  100 
 
 		 622 aa  1237    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  38.16 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  38.61 
 
 		 643 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  38.41 
 
 		 639 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  38.26 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  35.02 
 
 		 665 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  36.18 
 
 		 653 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  34.8 
 
 		 663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  32.79 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  33.13 
 
 		 677 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.8 
 
 		 653 aa  295  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  34.05 
 
 		 661 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  33.79 
 
 		 661 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  33.28 
 
 		 661 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  31.98 
 
 		 652 aa  270  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  31.07 
 
 		 627 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  31.38 
 
 		 598 aa  246  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  33 
 
 		 632 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 647 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.54 
 
 		 702 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  35.22 
 
 		 615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  32.43 
 
 		 610 aa  229  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 595 aa  226  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  29.69 
 
 		 594 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  32.74 
 
 		 607 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  29.01 
 
 		 674 aa  223  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  30.71 
 
 		 789 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  32.56 
 
 		 607 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  29.97 
 
 		 627 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.56 
 
 		 595 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  31.41 
 
 		 709 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  32.62 
 
 		 776 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.53 
 
 		 633 aa  200  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 670 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.11 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  27.26 
 
 		 593 aa  193  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.28 
 
 		 779 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  28.23 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  25.39 
 
 		 613 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 610 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  27.09 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  27.2 
 
 		 579 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  27.09 
 
 		 618 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.77 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 575 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.8 
 
 		 583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.15 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.21 
 
 		 752 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.75 
 
 		 583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.14 
 
 		 574 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 575 aa  124  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.88 
 
 		 770 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 580 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.58 
 
 		 793 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  26.19 
 
 		 893 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.4 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.76 
 
 		 806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.58 
 
 		 793 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.09 
 
 		 607 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.39 
 
 		 765 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.19 
 
 		 820 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  24.27 
 
 		 779 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.22 
 
 		 895 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  25.41 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  25.2 
 
 		 573 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  25.2 
 
 		 573 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  25.2 
 
 		 573 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 677 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  25.2 
 
 		 571 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  25.48 
 
 		 778 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.29 
 
 		 920 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  25.2 
 
 		 605 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.21 
 
 		 573 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  27.08 
 
 		 777 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  25 
 
 		 605 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0699  surface antigen (D15)  25.4 
 
 		 1083 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.208817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.39 
 
 		 801 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.63 
 
 		 596 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.89 
 
 		 888 aa  107  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.45 
 
 		 892 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  23.95 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.05 
 
 		 795 aa  106  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.05 
 
 		 795 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.05 
 
 		 795 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  24.55 
 
 		 611 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 582 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.06 
 
 		 752 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  24.55 
 
 		 611 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  26.62 
 
 		 578 aa  104  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  22.86 
 
 		 768 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  22.86 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  22.86 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  22.86 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  22.86 
 
 		 768 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>