More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0071 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  100 
 
 		 613 aa  1263    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  32.07 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  33.15 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  32.47 
 
 		 615 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  30.58 
 
 		 632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  28.32 
 
 		 647 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  27.71 
 
 		 663 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  28.18 
 
 		 665 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  29.84 
 
 		 593 aa  210  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  29.66 
 
 		 702 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.59 
 
 		 789 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.35 
 
 		 571 aa  203  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  29.21 
 
 		 661 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 661 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.87 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 776 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  27.92 
 
 		 653 aa  191  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 652 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  32.56 
 
 		 653 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  26.12 
 
 		 643 aa  177  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  26.07 
 
 		 622 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  29.37 
 
 		 709 aa  173  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.75 
 
 		 670 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  25.39 
 
 		 622 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 637 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  29.27 
 
 		 653 aa  167  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  24.59 
 
 		 610 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.17 
 
 		 607 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  29.44 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  28.62 
 
 		 779 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  24.19 
 
 		 677 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 633 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  29.85 
 
 		 595 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  27.43 
 
 		 674 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  26.82 
 
 		 607 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 607 aa  150  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  26.96 
 
 		 639 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  27.01 
 
 		 627 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  26.78 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  26.08 
 
 		 620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  26.67 
 
 		 627 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  25.65 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 610 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  23.72 
 
 		 597 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  22.38 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  23.49 
 
 		 611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 772 aa  99.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  22.82 
 
 		 583 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  24.09 
 
 		 609 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  22.65 
 
 		 588 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  21.95 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  22.16 
 
 		 583 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 585 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  23.1 
 
 		 596 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  21.59 
 
 		 818 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  21.6 
 
 		 583 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  23.08 
 
 		 765 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.81 
 
 		 896 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  24.33 
 
 		 564 aa  91.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  21.5 
 
 		 888 aa  91.3  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  22 
 
 		 582 aa  91.3  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  21.78 
 
 		 585 aa  90.9  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  22.87 
 
 		 577 aa  90.9  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 580 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.02 
 
 		 576 aa  90.5  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 677 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  22.45 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  22.88 
 
 		 677 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.02 
 
 		 618 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.41 
 
 		 895 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  22.84 
 
 		 657 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  22.28 
 
 		 577 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  20.59 
 
 		 573 aa  87  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  22.28 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  22.28 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.02 
 
 		 802 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  22.28 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.48 
 
 		 786 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.01 
 
 		 752 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  23.83 
 
 		 682 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.71 
 
 		 895 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  22.28 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  22.28 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  22.28 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  22.28 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  21.75 
 
 		 579 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  23.2 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 673 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26 
 
 		 835 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  21.37 
 
 		 807 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  21.31 
 
 		 579 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  21.68 
 
 		 765 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.61 
 
 		 584 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  21.95 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  22.78 
 
 		 668 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 772 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.57 
 
 		 808 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>