More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5265 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  100 
 
 
835 aa  1665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  29.22 
 
 
677 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  29.37 
 
 
677 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  29.77 
 
 
657 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  28.95 
 
 
673 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  24.88 
 
 
610 aa  160  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  27.19 
 
 
588 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.48 
 
 
770 aa  118  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  27.56 
 
 
632 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  26.53 
 
 
595 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  23.74 
 
 
820 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.72 
 
 
784 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  26.05 
 
 
779 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  24.46 
 
 
702 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  27.23 
 
 
622 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  28.79 
 
 
643 aa  108  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  26.72 
 
 
593 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  26.66 
 
 
670 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.17 
 
 
791 aa  106  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.8 
 
 
892 aa  105  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  26.4 
 
 
622 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  24.66 
 
 
785 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  26.79 
 
 
615 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  27.15 
 
 
627 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  21.63 
 
 
781 aa  98.2  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  26.7 
 
 
571 aa  97.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  21.79 
 
 
757 aa  97.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0688  surface antigen (D15)  23.82 
 
 
1024 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  25.9 
 
 
776 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0689  surface antigen (D15)  23.67 
 
 
1029 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  24.24 
 
 
1002 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  26.53 
 
 
702 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  21.98 
 
 
766 aa  95.9  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  26.27 
 
 
661 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.52 
 
 
769 aa  94.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  25.69 
 
 
652 aa  94.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  25.87 
 
 
595 aa  93.6  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  26.35 
 
 
653 aa  93.2  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0654  surface antigen (D15)  23.86 
 
 
1028 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  34.96 
 
 
663 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  22.94 
 
 
784 aa  92.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2804  surface antigen (D15)  24.17 
 
 
1005 aa  91.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.57 
 
 
893 aa  91.3  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  23.29 
 
 
620 aa  91.3  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.59 
 
 
848 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.28 
 
 
793 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.04 
 
 
895 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.5 
 
 
793 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.33 
 
 
665 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.14 
 
 
806 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.79 
 
 
765 aa  89.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  25.8 
 
 
594 aa  89.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.21 
 
 
769 aa  89.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  25.11 
 
 
627 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  22.08 
 
 
765 aa  88.6  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  22.56 
 
 
767 aa  88.2  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  34.36 
 
 
661 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  34.36 
 
 
661 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  22.32 
 
 
888 aa  87.4  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.9 
 
 
770 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  26.35 
 
 
705 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  26.38 
 
 
653 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.83 
 
 
785 aa  85.5  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0699  surface antigen (D15)  24.52 
 
 
1083 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.208817  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  26 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 
780 aa  84.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  20.83 
 
 
765 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  22.21 
 
 
794 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.48 
 
 
749 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.58 
 
 
808 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  25.32 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.64 
 
 
768 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  26.69 
 
 
598 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.31 
 
 
765 aa  82.4  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  33.16 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  20.9 
 
 
758 aa  82  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  20.91 
 
 
767 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  21.15 
 
 
765 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.22 
 
 
583 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  22.14 
 
 
674 aa  82  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.29 
 
 
770 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  21.09 
 
 
769 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  20.27 
 
 
768 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  26 
 
 
583 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  26.98 
 
 
639 aa  80.5  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.46 
 
 
574 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.07 
 
 
800 aa  80.5  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  20.27 
 
 
769 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.33 
 
 
769 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  20.27 
 
 
769 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  19.76 
 
 
768 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  24.39 
 
 
604 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.78 
 
 
583 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.12 
 
 
758 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  24.39 
 
 
604 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.96 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  19.63 
 
 
768 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  19.63 
 
 
769 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  29.77 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  19.63 
 
 
768 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>