More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1136 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  100 
 
 		 564 aa  1134    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.88 
 
 		 610 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.15 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.23 
 
 		 848 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 768 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 768 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.39 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 769 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 769 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 768 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 769 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 768 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 		 768 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.31 
 
 		 769 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.14 
 
 		 769 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.98 
 
 		 768 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.14 
 
 		 769 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.81 
 
 		 768 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.21 
 
 		 769 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  22.1 
 
 		 702 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.3 
 
 		 769 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.56 
 
 		 784 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.64 
 
 		 769 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.48 
 
 		 769 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  20.65 
 
 		 673 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.65 
 
 		 800 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  24.84 
 
 		 677 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  21.61 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.53 
 
 		 583 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.93 
 
 		 607 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  20.45 
 
 		 573 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.8 
 
 		 770 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  22.43 
 
 		 657 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  22.07 
 
 		 677 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  24.24 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.9 
 
 		 758 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  22.26 
 
 		 677 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  21.86 
 
 		 580 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  23.21 
 
 		 579 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  22.07 
 
 		 583 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  22.93 
 
 		 579 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  23.43 
 
 		 575 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  22.24 
 
 		 583 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  23.04 
 
 		 820 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  23.7 
 
 		 575 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.24 
 
 		 793 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.9 
 
 		 806 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  21.78 
 
 		 888 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  22.19 
 
 		 791 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.77 
 
 		 761 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.73 
 
 		 793 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  22.77 
 
 		 779 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.59 
 
 		 770 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  20.84 
 
 		 588 aa  94  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  22.92 
 
 		 767 aa  94  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 652 aa  94  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.5 
 
 		 892 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  22.24 
 
 		 661 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  23.42 
 
 		 603 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  24.33 
 
 		 613 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  25.24 
 
 		 571 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  22.17 
 
 		 758 aa  90.9  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  24.19 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  21.64 
 
 		 661 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.31 
 
 		 781 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  22.08 
 
 		 790 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  21.43 
 
 		 770 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.01 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  21.71 
 
 		 588 aa  89  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  22.06 
 
 		 765 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  21.24 
 
 		 661 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  22.56 
 
 		 765 aa  88.6  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.34 
 
 		 765 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  21.43 
 
 		 770 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  22.14 
 
 		 665 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.39 
 
 		 750 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.92 
 
 		 772 aa  88.6  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 		 765 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.07 
 
 		 596 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  25.29 
 
 		 558 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  21.32 
 
 		 785 aa  87  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  25 
 
 		 593 aa  87  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  21.57 
 
 		 765 aa  87  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  21.89 
 
 		 653 aa  86.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  21.21 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  19.48 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.51 
 
 		 780 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  19.93 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  26.43 
 
 		 622 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  23.59 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 671 aa  84.7  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  25.18 
 
 		 639 aa  83.6  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  20.84 
 
 		 559 aa  83.2  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.45 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  21.45 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  20.11 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  21.95 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>