More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3490 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  100 
 
 		 705 aa  1414    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.6 
 
 		 892 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 888 aa  138  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  24.7 
 
 		 1002 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.76 
 
 		 895 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.5 
 
 		 794 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.5 
 
 		 763 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.32 
 
 		 913 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 610 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  25.04 
 
 		 792 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.5 
 
 		 749 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  20.85 
 
 		 739 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  20.25 
 
 		 739 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  20.85 
 
 		 739 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  21.85 
 
 		 790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 820 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.84 
 
 		 821 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.59 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.08 
 
 		 595 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.17 
 
 		 895 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  21.62 
 
 		 763 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.98 
 
 		 751 aa  107  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.42 
 
 		 765 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.14 
 
 		 770 aa  104  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  23.4 
 
 		 784 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.4 
 
 		 806 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.01 
 
 		 831 aa  104  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  24.4 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.22 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.68 
 
 		 752 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.29 
 
 		 775 aa  102  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  23.68 
 
 		 779 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.08 
 
 		 793 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.75 
 
 		 793 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.01 
 
 		 787 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  22.04 
 
 		 757 aa  99.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.85 
 
 		 786 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.44 
 
 		 893 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.76 
 
 		 751 aa  99  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  24.41 
 
 		 637 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.26 
 
 		 791 aa  99  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.19 
 
 		 855 aa  98.2  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.67 
 
 		 582 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  23.59 
 
 		 788 aa  97.4  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.46 
 
 		 781 aa  97.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.67 
 
 		 808 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  21.3 
 
 		 820 aa  95.9  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  23.93 
 
 		 603 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.84 
 
 		 768 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  21.94 
 
 		 790 aa  96.3  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.53 
 
 		 804 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 795 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  23.7 
 
 		 896 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 		 765 aa  95.5  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  24.82 
 
 		 596 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  24.57 
 
 		 622 aa  95.9  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.7 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.69 
 
 		 573 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.5 
 
 		 758 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.7 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  22.95 
 
 		 765 aa  95.9  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.88 
 
 		 768 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.88 
 
 		 768 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  25 
 
 		 607 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.88 
 
 		 768 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.88 
 
 		 768 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.74 
 
 		 827 aa  94.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.53 
 
 		 768 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  24.46 
 
 		 777 aa  94.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.88 
 
 		 769 aa  94.7  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  23.75 
 
 		 674 aa  94  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.41 
 
 		 780 aa  94  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 827 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  23.03 
 
 		 826 aa  93.6  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.76 
 
 		 784 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.79 
 
 		 920 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 765 aa  93.6  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 830 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  24.03 
 
 		 778 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  21.9 
 
 		 767 aa  93.2  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.5 
 
 		 800 aa  92  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2804  surface antigen (D15)  21.52 
 
 		 1005 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.27 
 
 		 802 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.35 
 
 		 807 aa  91.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.42 
 
 		 803 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.59 
 
 		 752 aa  91.3  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.88 
 
 		 768 aa  91.3  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.75 
 
 		 805 aa  91.3  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.28 
 
 		 803 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 		 769 aa  90.5  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  22.54 
 
 		 826 aa  90.5  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  22.54 
 
 		 826 aa  90.5  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  27.36 
 
 		 688 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  22.65 
 
 		 826 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  23.14 
 
 		 766 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.01 
 
 		 769 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  22.65 
 
 		 826 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.65 
 
 		 826 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.01 
 
 		 769 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.31 
 
 		 761 aa  89.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>