More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2804 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2804  surface antigen (D15)  100 
 
 		 1005 aa  2072    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  28.59 
 
 		 1002 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.07 
 
 		 765 aa  151  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  22.47 
 
 		 751 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.83 
 
 		 793 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.68 
 
 		 913 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.22 
 
 		 793 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.96 
 
 		 806 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.77 
 
 		 752 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  23.71 
 
 		 820 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  22.41 
 
 		 888 aa  129  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.02 
 
 		 772 aa  124  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.68 
 
 		 808 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  23.25 
 
 		 769 aa  121  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.55 
 
 		 892 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  23.5 
 
 		 768 aa  118  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.88 
 
 		 802 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.27 
 
 		 769 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.27 
 
 		 769 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.22 
 
 		 768 aa  115  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.36 
 
 		 769 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.13 
 
 		 769 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 769 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 769 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 769 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 768 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.13 
 
 		 769 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 768 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 768 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  22.83 
 
 		 768 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  23.38 
 
 		 896 aa  110  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.85 
 
 		 848 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.11 
 
 		 769 aa  108  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  22.78 
 
 		 905 aa  107  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.46 
 
 		 752 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  20.75 
 
 		 790 aa  104  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.67 
 
 		 610 aa  104  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  21.49 
 
 		 763 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.39 
 
 		 770 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.38 
 
 		 791 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  21.62 
 
 		 785 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  22.8 
 
 		 795 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.81 
 
 		 895 aa  97.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.97 
 
 		 821 aa  96.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  22.78 
 
 		 792 aa  95.9  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  21.83 
 
 		 767 aa  95.5  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.65 
 
 		 857 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.84 
 
 		 856 aa  94.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  21.43 
 
 		 893 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  21.34 
 
 		 760 aa  94.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  21.52 
 
 		 770 aa  93.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.16 
 
 		 785 aa  92.8  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.84 
 
 		 791 aa  92.8  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.11 
 
 		 829 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  21.52 
 
 		 705 aa  92.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  24.17 
 
 		 835 aa  91.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  22.53 
 
 		 781 aa  90.5  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.53 
 
 		 781 aa  90.5  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  22.8 
 
 		 786 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0689  surface antigen (D15)  18.99 
 
 		 1029 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  22.8 
 
 		 786 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  22.69 
 
 		 794 aa  88.6  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.46 
 
 		 780 aa  88.6  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.43 
 
 		 763 aa  88.2  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  21.46 
 
 		 781 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  25 
 
 		 632 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.87 
 
 		 784 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  24.44 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  22.76 
 
 		 887 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.19 
 
 		 765 aa  86.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.1 
 
 		 750 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.74 
 
 		 841 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  22.4 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0688  surface antigen (D15)  22.71 
 
 		 1024 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.11 
 
 		 787 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  20.78 
 
 		 765 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  21.85 
 
 		 788 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  21.67 
 
 		 780 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.49 
 
 		 749 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  23.75 
 
 		 796 aa  82.4  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.64 
 
 		 785 aa  82.4  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.78 
 
 		 865 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.69 
 
 		 855 aa  82.4  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.46 
 
 		 787 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.04 
 
 		 844 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  20.82 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  21.97 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.9 
 
 		 920 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.88 
 
 		 854 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0699  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 1083 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.208817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.71 
 
 		 895 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  22.19 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.48 
 
 		 803 aa  79.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  20.82 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  23.02 
 
 		 661 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.07 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  20.72 
 
 		 781 aa  79  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.28 
 
 		 775 aa  79  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  20.42 
 
 		 765 aa  79  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>