More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2888 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  94.86 
 
 		 661 aa  1237    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  67.08 
 
 		 663 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  100 
 
 		 661 aa  1293    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  78.52 
 
 		 652 aa  946    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  68.58 
 
 		 665 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  95.46 
 
 		 661 aa  1242    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  47.58 
 
 		 677 aa  535  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  45.33 
 
 		 674 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  38.35 
 
 		 653 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  39.19 
 
 		 653 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 643 aa  301  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 653 aa  281  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  33.44 
 
 		 622 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  34.32 
 
 		 637 aa  273  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  32.87 
 
 		 622 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  32.63 
 
 		 620 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  32.03 
 
 		 671 aa  266  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  32.16 
 
 		 639 aa  261  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  32.01 
 
 		 639 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.56 
 
 		 776 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  33.66 
 
 		 632 aa  244  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  32.87 
 
 		 702 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  31.46 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.32 
 
 		 595 aa  229  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  28.43 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  30.5 
 
 		 789 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 593 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  29.55 
 
 		 594 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  28.41 
 
 		 627 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  27.9 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  29.25 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.97 
 
 		 595 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  29.07 
 
 		 607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  28.87 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 610 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 633 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.57 
 
 		 571 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  28.12 
 
 		 670 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 779 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  28.28 
 
 		 709 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.16 
 
 		 610 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.83 
 
 		 575 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.84 
 
 		 582 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 558 aa  113  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  26.35 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.68 
 
 		 583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.77 
 
 		 607 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  23.63 
 
 		 580 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.06 
 
 		 583 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  24.7 
 
 		 603 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.02 
 
 		 583 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.37 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  25.85 
 
 		 579 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  22.3 
 
 		 601 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.94 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  21.51 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.94 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  23.93 
 
 		 593 aa  101  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.9 
 
 		 574 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  23.45 
 
 		 702 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  25.95 
 
 		 573 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.72 
 
 		 579 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.74 
 
 		 574 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  22.79 
 
 		 629 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 835 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 806 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 		 793 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  33.73 
 
 		 611 aa  94.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  24.15 
 
 		 584 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  22.62 
 
 		 612 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.72 
 
 		 892 aa  92.8  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.26 
 
 		 793 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25 
 
 		 820 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.15 
 
 		 751 aa  90.5  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.08 
 
 		 920 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 760 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  21.73 
 
 		 598 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  21.24 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.43 
 
 		 893 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  24.37 
 
 		 798 aa  84  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.64 
 
 		 803 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.64 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 578 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.27 
 
 		 777 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.81 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.24 
 
 		 895 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  25.81 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.14 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  25.77 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.57 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.52 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  26.1 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  23.77 
 
 		 611 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  24.32 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  23.49 
 
 		 739 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>