More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2389 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  78.99 
 
 		 661 aa  969    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  77.28 
 
 		 661 aa  971    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  67.08 
 
 		 665 aa  821    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  65.51 
 
 		 663 aa  789    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  100 
 
 		 652 aa  1270    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  78.04 
 
 		 661 aa  970    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  47.31 
 
 		 677 aa  522  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  44.5 
 
 		 674 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  39.73 
 
 		 653 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  39.94 
 
 		 653 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  35.59 
 
 		 643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  33.38 
 
 		 622 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  33.63 
 
 		 637 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  32.61 
 
 		 622 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  30.19 
 
 		 653 aa  270  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  33.72 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  31.56 
 
 		 671 aa  266  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  31.36 
 
 		 639 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  31.21 
 
 		 639 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.82 
 
 		 776 aa  238  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  31.44 
 
 		 632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.64 
 
 		 595 aa  231  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.55 
 
 		 702 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.7 
 
 		 789 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 647 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  28.43 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  28.36 
 
 		 594 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  28.12 
 
 		 627 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  27.17 
 
 		 588 aa  190  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  27.29 
 
 		 613 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.92 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  28.17 
 
 		 607 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.74 
 
 		 633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 627 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28 
 
 		 607 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  30.65 
 
 		 709 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 610 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.53 
 
 		 571 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  24.39 
 
 		 610 aa  150  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.22 
 
 		 670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  29.52 
 
 		 779 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  26.85 
 
 		 598 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  27.21 
 
 		 555 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.06 
 
 		 607 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  24.04 
 
 		 576 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  24.56 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  26.41 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  24.04 
 
 		 618 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  23.28 
 
 		 597 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  26.74 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.66 
 
 		 575 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.16 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 580 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 583 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.77 
 
 		 583 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.28 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  27.31 
 
 		 558 aa  100  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  28.72 
 
 		 573 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  25.67 
 
 		 559 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.17 
 
 		 574 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  24.63 
 
 		 593 aa  95.5  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.95 
 
 		 808 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  26.38 
 
 		 611 aa  94.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  25.94 
 
 		 835 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.54 
 
 		 920 aa  94  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  25.96 
 
 		 579 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 611 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.5 
 
 		 609 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  23.88 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  22.96 
 
 		 629 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.75 
 
 		 848 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 896 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.62 
 
 		 585 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.32 
 
 		 802 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.56 
 
 		 579 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.91 
 
 		 751 aa  89.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  27.44 
 
 		 596 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  22.73 
 
 		 612 aa  87.8  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 611 aa  87.4  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  25.99 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.43 
 
 		 820 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.12 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 601 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.91 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.86 
 
 		 892 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2804  surface antigen (D15)  21.97 
 
 		 1005 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  23.46 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.07 
 
 		 760 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  21.99 
 
 		 913 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0689  surface antigen (D15)  23.04 
 
 		 1029 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  26.58 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 		 752 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.08 
 
 		 793 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.9 
 
 		 793 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  24.33 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.02 
 
 		 752 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>