More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0071 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  100 
 
 		 633 aa  1269    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  39.32 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  30.53 
 
 		 620 aa  213  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  30.53 
 
 		 622 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  30.16 
 
 		 637 aa  208  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  29.08 
 
 		 622 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  29.8 
 
 		 665 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  29.07 
 
 		 639 aa  200  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  28.91 
 
 		 639 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  29.11 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  28.96 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  28.15 
 
 		 643 aa  193  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  28.64 
 
 		 677 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  28.08 
 
 		 661 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  27.69 
 
 		 671 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.09 
 
 		 661 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 653 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  29.38 
 
 		 663 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  28.08 
 
 		 661 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  30.2 
 
 		 674 aa  180  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  26.11 
 
 		 595 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 652 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  31.85 
 
 		 776 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 702 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  32.92 
 
 		 670 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  26.65 
 
 		 588 aa  170  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  25.36 
 
 		 653 aa  169  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 615 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  27.55 
 
 		 613 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 598 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  26.89 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 789 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  28.45 
 
 		 607 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28.45 
 
 		 607 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  25.57 
 
 		 627 aa  142  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  28.16 
 
 		 709 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  27.68 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 610 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  23.93 
 
 		 594 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.72 
 
 		 610 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 618 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.63 
 
 		 808 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 555 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 583 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.76 
 
 		 802 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  23.84 
 
 		 583 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 580 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  23.66 
 
 		 583 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  25 
 
 		 752 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  24.49 
 
 		 594 aa  101  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.76 
 
 		 765 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  23.65 
 
 		 769 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  22.99 
 
 		 576 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  22.99 
 
 		 618 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  22.36 
 
 		 603 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 571 aa  97.8  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.94 
 
 		 607 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  23.51 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  22.91 
 
 		 578 aa  97.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.57 
 
 		 575 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  26.23 
 
 		 593 aa  95.9  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 582 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  26.58 
 
 		 585 aa  95.1  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  24.62 
 
 		 578 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 578 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  23.8 
 
 		 577 aa  94.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  23.36 
 
 		 577 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  23.36 
 
 		 577 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  23.36 
 
 		 577 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  23.36 
 
 		 577 aa  93.6  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.37 
 
 		 574 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  23.36 
 
 		 577 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  23.36 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  23.36 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  23.36 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  23.36 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.37 
 
 		 752 aa  92.8  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 785 aa  92  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.11 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  27.25 
 
 		 585 aa  90.9  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  23.88 
 
 		 579 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.13 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.13 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.37 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  24.56 
 
 		 575 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.13 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  35.04 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.36 
 
 		 577 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.13 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.05 
 
 		 579 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  22.99 
 
 		 578 aa  88.6  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  21.92 
 
 		 591 aa  88.2  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.6 
 
 		 751 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  22.34 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>