More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2905 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  100 
 
 		 789 aa  1550    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  54.79 
 
 		 776 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  39.34 
 
 		 702 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  36.96 
 
 		 615 aa  310  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  35.73 
 
 		 632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 595 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  32.46 
 
 		 663 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  31.15 
 
 		 665 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  31.83 
 
 		 622 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  30.97 
 
 		 622 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  28.95 
 
 		 588 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  30.15 
 
 		 652 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  30.42 
 
 		 661 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  30.07 
 
 		 661 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  30 
 
 		 677 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  32.26 
 
 		 653 aa  239  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  30.42 
 
 		 661 aa  238  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  30.28 
 
 		 620 aa  237  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  29.59 
 
 		 613 aa  231  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  31.79 
 
 		 670 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  30.21 
 
 		 653 aa  226  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 637 aa  218  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  28.83 
 
 		 647 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  30.88 
 
 		 593 aa  200  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.22 
 
 		 595 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  26.38 
 
 		 653 aa  198  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  29.86 
 
 		 709 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  29.87 
 
 		 779 aa  193  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  28.55 
 
 		 639 aa  189  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.24 
 
 		 571 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  28.4 
 
 		 639 aa  187  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 674 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  27.95 
 
 		 671 aa  183  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  27.04 
 
 		 643 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  27.27 
 
 		 594 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 633 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  26.23 
 
 		 627 aa  161  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  27.05 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.59 
 
 		 610 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  30.31 
 
 		 607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  30.13 
 
 		 607 aa  147  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 627 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  26.25 
 
 		 598 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  25.29 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.23 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.57 
 
 		 579 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  27.52 
 
 		 596 aa  111  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.08 
 
 		 574 aa  107  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.87 
 
 		 575 aa  105  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.54 
 
 		 583 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.27 
 
 		 583 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.55 
 
 		 580 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.51 
 
 		 582 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.75 
 
 		 574 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.87 
 
 		 583 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  23.17 
 
 		 555 aa  98.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  40.85 
 
 		 607 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.15 
 
 		 571 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.39 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.39 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.39 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.39 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 571 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.39 
 
 		 577 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  24.24 
 
 		 558 aa  92  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  23.79 
 
 		 577 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  23.44 
 
 		 578 aa  90.9  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  26.81 
 
 		 646 aa  88.2  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 573 aa  87.8  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  25.4 
 
 		 573 aa  87.8  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 696 aa  87.8  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  22.42 
 
 		 601 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  22.69 
 
 		 591 aa  87.4  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  23.57 
 
 		 584 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 612 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  27.57 
 
 		 609 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.08 
 
 		 769 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.45 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  24.29 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  22.94 
 
 		 576 aa  83.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 618 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  26.86 
 
 		 677 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  24.25 
 
 		 673 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  34.65 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 677 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  22.94 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  22.94 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  22.94 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  22.94 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  22.94 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 		 769 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  22.94 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  22.94 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  20.97 
 
 		 751 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  22.94 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.92 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.92 
 
 		 769 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  22.74 
 
 		 578 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  22.74 
 
 		 578 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>