More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0384 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  100 
 
 		 615 aa  1225    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  36.09 
 
 		 595 aa  330  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  36.96 
 
 		 789 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  36.83 
 
 		 632 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  41.2 
 
 		 776 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  33.97 
 
 		 588 aa  296  7e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  34.16 
 
 		 663 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  33.81 
 
 		 702 aa  281  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  32.93 
 
 		 665 aa  272  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  32.47 
 
 		 613 aa  266  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  36.27 
 
 		 622 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  35.22 
 
 		 622 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.98 
 
 		 637 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  35.26 
 
 		 593 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  30.98 
 
 		 661 aa  249  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  31.16 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  31.31 
 
 		 661 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  32.47 
 
 		 653 aa  238  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  33.85 
 
 		 571 aa  238  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  31.48 
 
 		 652 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  32.7 
 
 		 595 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  35.15 
 
 		 647 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  32.13 
 
 		 620 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  31.92 
 
 		 670 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  33.55 
 
 		 671 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 677 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  33.57 
 
 		 779 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  34.19 
 
 		 643 aa  219  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  32.27 
 
 		 709 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  30.53 
 
 		 639 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  30.36 
 
 		 639 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  29.54 
 
 		 653 aa  211  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  30 
 
 		 653 aa  209  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  30.23 
 
 		 674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  31.79 
 
 		 607 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  31.58 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.39 
 
 		 610 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  31.68 
 
 		 627 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  28.87 
 
 		 627 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  27.99 
 
 		 582 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  31.53 
 
 		 610 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  29.93 
 
 		 594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  29.46 
 
 		 584 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.98 
 
 		 573 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25.14 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 618 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  27.17 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  26.22 
 
 		 591 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 598 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  28.82 
 
 		 629 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.33 
 
 		 607 aa  150  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 575 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  25.42 
 
 		 618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  26.05 
 
 		 591 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  25.7 
 
 		 591 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1897  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 621 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.953875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  28.32 
 
 		 612 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 617 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 617 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 617 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 617 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.45 
 
 		 579 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  27.77 
 
 		 578 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  26.34 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  25.43 
 
 		 613 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  27.07 
 
 		 677 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.89 
 
 		 677 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.88 
 
 		 575 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.04 
 
 		 657 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  26.57 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  26.57 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 609 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 577 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  25.57 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  25.57 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.27 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  26.19 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  25.57 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  25.57 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  25.8 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  28.28 
 
 		 573 aa  134  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 571 aa  133  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.08 
 
 		 574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.27 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  24.65 
 
 		 636 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 580 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 583 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.86 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  25.81 
 
 		 573 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.81 
 
 		 570 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.65 
 
 		 770 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  25.91 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>